RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 HMOX1P09601 288 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFAP53Q96M91 514 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM37O94972 964 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYP27B1O15528 508 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDRP35968 1356 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNQ2O43526 872 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPG7Q9UQ90 795 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUDCQ9Y266 331 aa23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC125Q86Z20 511 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCL9O00512 1426 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 SBF2Q86WG5 1849 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANP32CO43423 234 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 APBA3O96018 575 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHKG2P15735 406 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRKAR2BP31323 418 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC184Q52MB2 194 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1-204ENST00000563065 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 BAG6P46379 1132 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 FCHSD2O94868 740 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 NHSQ6T4R5 1651 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCAF5Q96JK2 942 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 LGR6Q9HBX8 967 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIGBQ92521 554 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 BTAF1O14981 1849 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLSCR1O15162 318 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 PROM2Q8N271 834 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITGB4P16144 1822 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRS2Q9HD23 443 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNQ4P56696 695 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 CABP4P57796 275 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 TXNRD1Q16881 649 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 IL17REQ8NFR9 667 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP3K5Q99683 1374 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-204ENST00000563065 NEFMP07197 916 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCTN1Q14203 1278 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATG3Q9NT62 314 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCM10Q7L590 875 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 NFE2L2Q16236 605 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 RUNDC1Q96C34 613 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 PALLDQ8WX93 1383 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 RREB1Q92766 1687 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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