RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554716.5

PRMT5-215, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 4

Gene PRMT5, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-215	ENST00000554716	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PRMT5-215	ENST00000554716	MEGF6	O75095	1541 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PRMT5-215	ENST00000554716	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRMT5-215	ENST00000554716	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRMT5-215	ENST00000554716	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PRMT5-215	ENST00000554716	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PRMT5-215	ENST00000554716	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PRMT5-215	ENST00000554716	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	INSR	P06213	1382 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	ARX	Q96QS3	562 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	FLT4	P35916	1363 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	NSD2	O96028	1365 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PRMT5-215	ENST00000554716	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	LY75	O60449	1722 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	KCNQ4	P56696	695 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	MAP3K5	Q99683	1374 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	POLD1	P28340	1107 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRMT5-215	ENST00000554716	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRMT5-215	ENST00000554716	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PRMT5-215	ENST00000554716	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PRMT5-215	ENST00000554716	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRMT5-215	ENST00000554716	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRMT5-215	ENST00000554716	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
PRMT5-215	ENST00000554716	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	CYP27B1	O15528	508 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	KLHL34	Q8N239	644 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	MSH5	O43196	834 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	CHD4	Q14839	1912 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	PALLD	Q8WX93	1383 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	SPG7	Q9UQ90	795 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PRMT5-215	ENST00000554716	GPR162	Q16538	588 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	C5	P01031	1676 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	UTRN	P46939	3433 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	EYA1	Q99502	592 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.98	■■■□□ 2.23	7e-8	■■■■□ 23.1
PRMT5-215	ENST00000554716	ITGB4	P16144	1822 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.97	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PRMT5-215	ENST00000554716	PIGB	Q92521	554 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	AK7	Q96M32	723 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PRMT5-215	ENST00000554716	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PRMT5-215	ENST00000554716	PHKG2	P15735	406 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PRMT5-215	ENST00000554716	PANK3	Q9H999	370 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PRMT5-215	ENST00000554716	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRMT5-215	ENST00000554716	SIK1	P57059	783 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRMT5-215	ENST00000554716	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRMT5-215	ENST00000554716	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PRMT5-215	ENST00000554716	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRMT5-215	ENST00000554716	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	PHF14	O94880	888 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	SSFA2	P28290	1259 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2	3e-8	■□□□□ 8.7
PRMT5-215	ENST00000554716	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PRMT5-215	ENST00000554716	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2

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