RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SDR39U1-208	ENST00000554698	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
SDR39U1-208	ENST00000554698	HMOX1	P09601	288 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM182B	Q5T319	152 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SDR39U1-208	ENST00000554698	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.71	■■■□□ 2.19
SDR39U1-208	ENST00000554698	BCL9	O00512	1426 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	28.67	■■■□□ 2.18	6e-10	■■■■□ 25.3
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	EP400	Q96L91	3159 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	CYP27B1	O15528	508 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	FCHSD2	O94868	740 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	SOCS7	O14512	581 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.59	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	PHKG2	P15735	406 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC125	Q86Z20	511 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRIM37	O94972	964 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.53	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SDR39U1-208	ENST00000554698	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	KCNQ2	O43526	872 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	SBF2	Q86WG5	1849 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	NHS	Q6T4R5	1651 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
SDR39U1-208	ENST00000554698	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	NEFM	P07197	916 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	APBA3	O96018	575 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SDR39U1-208	ENST00000554698	BAG6	P46379	1132 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	NFE2L2	Q16236	605 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	MIER1	Q8N108	512 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	LGR6	Q9HBX8	967 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLSCR1	O15162	318 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	PIGB	Q92521	554 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	BTAF1	O14981	1849 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	MRC1	P22897	1456 aa		28.33	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	CABP4	P57796	275 aa		28.33	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
SDR39U1-208	ENST00000554698	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		28.31	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	ITGB4	P16144	1822 aa		28.3	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.3	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	RIPK4	P57078	832 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	MCM10	Q7L590	875 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SDR39U1-208	ENST00000554698	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		28.27	■■■□□ 2.12

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