RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.82□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.82□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 LTN1O94822 1766 aa9.81□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.8□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 ADCY9O60503 1353 aa9.8□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.8□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 USP54Q70EL1 1684 aa9.8□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A1W2PP64 1363 aa9.79□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.79□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 PCNTO95613 3336 aa9.79□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.79□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 LY75O60449 1722 aa9.79□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.79□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.79□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 NEUROD1Q13562 356 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 IP6K1Q92551 441 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 NBPF4Q96M43 638 aa9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
CTDSP2-208ENST00000552294 KIF3CO14782 793 aa9.77□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 POLD1P28340 1107 aa9.77□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 HTRA3P83110 453 aa9.77□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 TMC1Q8TDI8 760 aa9.77□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 HSPA6P17066 643 aa9.76□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXC9P31274 260 aa9.76□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP27B1O15528 508 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 PHF14O94880 888 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.72□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 GRIN3BO60391 1043 aa9.72□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 ITPK1Q13572 414 aa9.72□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.72□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.72□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 TESK2Q96S53 571 aa9.72□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 C5P01031 1676 aa9.71□□□□□ -0.85
CTDSP2-208ENST00000552294 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.71□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.71□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 PALLDQ8WX93 1383 aa9.71□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.7□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 PIGBQ92521 554 aa9.7□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.7□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.7□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.7□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 USP47Q96K76 1375 aa9.7□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 FYB1O15117 783 aa9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 C4BP0C0L5 1744 aa9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 AMPHP49418 695 aa9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.69□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.68□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A0G2JLW4 131 aa9.68□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.68□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.67□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.67□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.67□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNA3P22001 575 aa9.66□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 COG3Q96JB2 828 aa9.66□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.66□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 CAPN15O75808 1086 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 MMP10P09238 476 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 PRELPP51888 382 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDSP2-208ENST00000552294 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 ITGB4P16144 1822 aa9.64□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 DPEP1P16444 411 aa9.64□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 AK7Q96M32 723 aa9.64□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF39Q9H2S5 420 aa9.64□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 ATG3Q9NT62 314 aa9.64□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 GNPATO15228 680 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 SIK1P57059 783 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 BCS1LQ9Y276 419 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 INSRP06213 1382 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 NCAPD2Q15021 1401 aa9.62□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 RTL1A6NKG5 1358 aa9.62□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.61□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.61□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.61□□□□□ -0.87
CTDSP2-208ENST00000552294 EYA1Q99502 592 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms