RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 NME9Q86XW9 330 aa19.82■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.82■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 USP31Q70CQ4 1352 aa19.82■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.81■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa19.8■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 C5P01031 1676 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 RGPD2P0DJD1 1756 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-230ENST00000551968 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 AMIGO3Q86WK7 504 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.74■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 SMIM5Q71RC9 77 aa19.74■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 IGSF1Q8N6C5 1336 aa19.74■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 MEGF6O75095 1541 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 APLP1P51693 650 aa19.73■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 CAPN15O75808 1086 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-230ENST00000551968 WDR90Q96KV7 1748 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 USP47Q96K76 1375 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 HTRA3P83110 453 aa19.69■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 IP6K1Q92551 441 aa19.69■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 FBLN1P23142 703 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 C4BP0C0L5 1744 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-230ENST00000551968 TOMM70O94826 608 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 PCNTO95613 3336 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 PALLDQ8WX93 1383 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 PHF14O94880 888 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 HOXC9P31274 260 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 FLAD1Q8NFF5 587 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 TMC1Q8TDI8 760 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 A0A1W2PP64 1363 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 ITGB4P16144 1822 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 NBPF6Q5VWK0 638 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 JMYQ8N9B5 988 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 KLRG1Q96E93 195 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 NBPF4Q96M43 638 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.58■□□□□ 0.73
CS-230ENST00000551968 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 AK7Q96M32 723 aa19.57■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 TNS4Q8IZW8 715 aa19.56■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 PRELPP51888 382 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 AMPHP49418 695 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 LINC00116Q8NCU8 138 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 BCS1LQ9Y276 419 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 A0A0G2JLW4 131 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CS-230ENST00000551968 CYP27B1O15528 508 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 MMP10P09238 476 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 SSFA2P28290 1259 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 PIGBQ92521 554 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 ITPK1Q13572 414 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 COG3Q96JB2 828 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 DPEP1P16444 411 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 C9orf131Q5VYM1 1079 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.46■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 GNPATO15228 680 aa19.46■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CS-230ENST00000551968 RTL1A6NKG5 1358 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 SIK1P57059 783 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 FSTL1Q12841 308 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.44■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 FCHSD2O94868 740 aa19.44■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 TGFB2P61812 414 aa19.44■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 C4AP0C0L4 1744 aa19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.6 ms