RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 VPS72Q15906 364 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 TCP11L2Q8N4U5 519 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 APAF1O14727 1248 aa12.24□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 PKD1L3Q7Z443 1732 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.23□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.22□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.21□□□□□ -0.45
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CS-220ENST00000550700 WDR63Q8IWG1 891 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-220ENST00000550700 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.2□□□□□ -0.46
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CS-220ENST00000550700 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
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CS-220ENST00000550700 USP35Q9P2H5 1018 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-220ENST00000550700 MAP3K5Q99683 1374 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-220ENST00000550700 IL16Q14005 1332 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-220ENST00000550700 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
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CS-220ENST00000550700 ZNF521Q96K83 1311 aa12.15□□□□□ -0.46
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CS-220ENST00000550700 E9PSI1 815 aa12.15□□□□□ -0.46
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CS-220ENST00000550700 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-220ENST00000550700 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.15□□□□□ -0.46
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CS-220ENST00000550700 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-220ENST00000550700 SLFN5Q08AF3 891 aa12.1□□□□□ -0.47
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