RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 PDE3BQ13370 1112 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 CHRNA2Q15822 529 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 IFFO2Q5TF58 517 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 KIAA0232Q92628 1395 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 DLC1Q96QB1 1528 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 MYOM1P52179 1685 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-217ENST00000550044 CASZ1Q86V15 1759 aa13.71□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.7□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 WASLO00401 505 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 RIMBP2O15034 1052 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 C1QTNF8P60827 252 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 SSH2Q76I76 1423 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 CHD4Q14839 1912 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 CDK19Q9BWU1 502 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 EVA1CP58658 441 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 BARGINQ6ZT62 677 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 CABP2Q9NPB3 220 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 ZBTB7AO95365 584 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CS-217ENST00000550044 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 ITSN1Q15811 1721 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 SBF2Q86WG5 1849 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 PEAK1Q9H792 1746 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 CEP350Q5VT06 3117 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 LMO7Q8WWI1 1683 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 ATP7BP35670 1465 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 PTGER2P43116 358 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 LRRC37A3O60309 1634 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 SYT17Q9BSW7 474 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-217ENST00000550044 PLSCR1O15162 318 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 PTF1AQ7RTS3 328 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 EVC2Q86UK5 1308 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 AKAP12Q02952 1782 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 STK32BQ9NY57 414 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 CABP1Q9NZU7 370 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 ACEP12821 1306 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 CPDO75976 1380 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 CRB1P82279 1406 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 DDB1Q16531 1140 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 MTFR1LQ9H019 292 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-217ENST00000550044 SLC15A2Q16348 729 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 ABTB2Q8N961 1025 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 USP19O94966 1318 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 GPR162Q16538 588 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 TXNRD1Q16881 649 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 ARXQ96QS3 562 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 TESK2Q96S53 571 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 USP47Q96K76 1375 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-217ENST00000550044 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
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