RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.13□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.12□□□□□ -0.63
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.02□□□□□ -0.65
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.01□□□□□ -0.65
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMOD3Q9NYL9 352 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNS2Q63HR2 1409 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.99□□□□□ -0.65
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