RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525786.1

CCDC82-204, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC82, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-204ENST00000525786 APLP1P51693 650 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC82-204ENST00000525786 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CCDC82-204ENST00000525786 USP31Q70CQ4 1352 aa24.12■■□□□ 1.45
CCDC82-204ENST00000525786 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CCDC82-204ENST00000525786 NSD2O96028 1365 aa24.1■■□□□ 1.45
CCDC82-204ENST00000525786 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
CCDC82-204ENST00000525786 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.09■■□□□ 1.45
CCDC82-204ENST00000525786 USP47Q96K76 1375 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC82-204ENST00000525786 KIF3CO14782 793 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC82-204ENST00000525786 WDR90Q96KV7 1748 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC82-204ENST00000525786 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC82-204ENST00000525786 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC82-204ENST00000525786 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCDC82-204ENST00000525786 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CCDC82-204ENST00000525786 NME9Q86XW9 330 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC82-204ENST00000525786 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC82-204ENST00000525786 WWC3Q9ULE0 1092 aa24■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 C4BP0C0L5 1744 aa23.99■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 TOMM70O94826 608 aa23.99■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.99■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.99■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 IP6K1Q92551 441 aa23.98■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.98■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.97■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.97■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 MEGF6O75095 1541 aa23.96■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CCDC82-204ENST00000525786 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.95■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 CAPN15O75808 1086 aa23.95■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 AK7Q96M32 723 aa23.93■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 PALLDQ8WX93 1383 aa23.92■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.9■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 TMC1Q8TDI8 760 aa23.9■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 ITGB4P16144 1822 aa23.89■■□□□ 1.42
CCDC82-204ENST00000525786 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 PHF14O94880 888 aa23.88■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 TNS4Q8IZW8 715 aa23.88■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 KLRG1Q96E93 195 aa23.88■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.87■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 PRELPP51888 382 aa23.87■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.87■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 HOXC9P31274 260 aa23.86■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 PCNTO95613 3336 aa23.86■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 AMPHP49418 695 aa23.85■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 JMYQ8N9B5 988 aa23.85■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.85■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 A0A1W2PP64 1363 aa23.85■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.84■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.84■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.84■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.84■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.83■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 SSFA2P28290 1259 aa23.83■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.83■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.83■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.83■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.83■■□□□ 1.41
CCDC82-204ENST00000525786 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 RTL1A6NKG5 1358 aa23.81■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.8■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 HTRA3P83110 453 aa23.8■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.8■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 COG3Q96JB2 828 aa23.8■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.8■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 BCS1LQ9Y276 419 aa23.8■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 FSTL1Q12841 308 aa23.79■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.78■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.77■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.77■■□□□ 1.4
CCDC82-204ENST00000525786 TGFB2P61812 414 aa23.76■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.76■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 NBPF4Q96M43 638 aa23.76■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 SMIM5Q71RC9 77 aa23.75■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 MMP10P09238 476 aa23.74■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.73■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 GNPATO15228 680 aa23.72■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.72■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 C4AP0C0L4 1744 aa23.71■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.71■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 FCHSD2O94868 740 aa23.71■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.71■■□□□ 1.39
CCDC82-204ENST00000525786 A0A0G2JLW4 131 aa23.7■■□□□ 1.38
CCDC82-204ENST00000525786 FBLN1P23142 703 aa23.7■■□□□ 1.38
CCDC82-204ENST00000525786 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.69■■□□□ 1.38
CCDC82-204ENST00000525786 SIK1P57059 783 aa23.69■■□□□ 1.38
CCDC82-204ENST00000525786 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.69■■□□□ 1.38
CCDC82-204ENST00000525786 SLC34A2O95436 690 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms