RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 C8orf37Q96NL8 207 aa28.94■■■□□ 2.22
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ACER3-202ENST00000525194 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
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ACER3-202ENST00000525194 IL16Q14005 1332 aa28.89■■■□□ 2.21
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ACER3-202ENST00000525194 USP35Q9P2H5 1018 aa28.84■■■□□ 2.21
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ACER3-202ENST00000525194 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.82■■■□□ 2.2
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ACER3-202ENST00000525194 AFF2P51816 1311 aa28.77■■■□□ 2.2
ACER3-202ENST00000525194 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.77■■■□□ 2.2
ACER3-202ENST00000525194 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.77■■■□□ 2.2
ACER3-202ENST00000525194 GNAI1P63096 354 aa28.77■■■□□ 2.2
ACER3-202ENST00000525194 BARGINQ6ZT62 677 aa28.77■■■□□ 2.2
ACER3-202ENST00000525194 IFT57Q9NWB7 429 aa28.77■■■□□ 2.2
ACER3-202ENST00000525194 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.76■■■□□ 2.19
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ACER3-202ENST00000525194 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.68■■■□□ 2.18
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ACER3-202ENST00000525194 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.67■■■□□ 2.18
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ACER3-202ENST00000525194 TNS2Q63HR2 1409 aa28.66■■■□□ 2.18
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ACER3-202ENST00000525194 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.62■■■□□ 2.17
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ACER3-202ENST00000525194 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.59■■■□□ 2.17
ACER3-202ENST00000525194 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-202ENST00000525194 GLI3P10071 1580 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-202ENST00000525194 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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ACER3-202ENST00000525194 BTBD11A6QL63 1104 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-202ENST00000525194 CABP4P57796 275 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-202ENST00000525194 A0A0G2JS52 829 aa28.55■■■□□ 2.16
ACER3-202ENST00000525194 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
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