RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519376.5

FBXO25-208, Transcript of F-box protein 25, human

TSL 3

Gene FBXO25, Length 418 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO25-208	ENST00000519376	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	JDP2	Q8WYK2	163 aa		9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	C8orf48	Q96LL4	319 aa		9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	BACH2	Q9BYV9	841 aa		9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	TMX1	Q9H3N1	280 aa		9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		9.09	□□□□□ -0.95
FBXO25-208	ENST00000519376	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	WASHC4	Q2M389	1173 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	FAM161A	Q3B820	660 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	DRC7	Q8IY82	874 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	IL17RA	Q96F46	866 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	SHROOM2	Q13796	1616 aa		9.08	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	CUL7	Q14999	1698 aa		9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PLIN1	O60240	522 aa		9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	RBL2	Q08999	1139 aa		9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		9.07	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	POTEM	A6NI47	508 aa		9.06	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	POTEJ	P0CG39	1038 aa		9.06	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	CDCA8	Q53HL2	280 aa		9.06	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		9.06	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	FCHSD2	O94868	740 aa		9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PPM1E	Q8WY54	764 aa		9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	KIF12	Q96FN5	646 aa		9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	FRMD6	Q96NE9	622 aa		9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	CAPN10	Q9HC96	672 aa		9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	ERBB3	P21860	1342 aa		9.05	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	CBFA2T2	O43439	604 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TIMM44	O43615	452 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	COL6A1	P12109	1028 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	COL19A1	Q14993	1142 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PDIA6	Q15084	440 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TSC1	Q92574	1164 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	RUNDC1	Q96C34	613 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		9.04	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	RGS20	O76081	388 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PDGFRB	P09619	1106 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	RASSF7	Q02833	373 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	POTEG	Q6S5H5	508 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	GML	Q99445	158 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		9.02	□□□□□ -0.96
FBXO25-208	ENST00000519376	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
FBXO25-208	ENST00000519376	FGA	P02671	866 aa		9.02	□□□□□ -0.97
FBXO25-208	ENST00000519376	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
FBXO25-208	ENST00000519376	VPS72	Q15906	364 aa		9.02	□□□□□ -0.97
FBXO25-208	ENST00000519376	NFE2L2	Q16236	605 aa		9.02	□□□□□ -0.97
FBXO25-208	ENST00000519376	ODR4	Q5SWX8	454 aa		9.02	□□□□□ -0.97
FBXO25-208	ENST00000519376	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
FBXO25-208	ENST00000519376	CASS4	Q9NQ75	786 aa		9.02	□□□□□ -0.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms