RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GJA5P36382 358 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CARD14Q9BXL6 1004 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DYRK1BQ9Y463 629 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AMPD1P23109 780 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PTGIRP43119 386 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRP8Q14114 963 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLRG1Q96E93 195 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DYRK3O43781 588 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC102AQ96A19 550 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TXKP42681 527 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DGKGP49619 791 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MCTP1Q6DN14 999 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBTB3Q9H5J0 574 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HRCP23327 699 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPC1P35052 558 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PHF24Q9UPV7 400 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAX4O43316 350 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LILRA1O75019 489 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BTBD6Q96KE9 485 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 F11P03951 625 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EPXP11678 715 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDXDC2PQ6P474 469 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FMNL2Q96PY5 1086 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GGA1Q9UJY5 639 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POU4F2Q12837 409 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WDR44Q5JSH3 913 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSC1Q92574 1164 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 THBS1P07996 1170 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BMP4P12644 408 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FZD5Q13467 585 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBTB33Q86T24 672 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NBPF15Q8N660 670 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CABLES1Q8TDN4 633 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF135Q8IUD6 432 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MEN1O00255 615 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C2CD2LO14523 706 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC27A3Q5K4L6 730 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHSY3Q70JA7 882 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRIM52Q96A61 297 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRIM11Q96F44 468 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARAFP10398 606 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RAB15P59190 212 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RIC3Q7Z5B4 369 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLVAPQ9BX97 442 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 APBA3O96018 575 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LAMC2Q13753 1193 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PRU2 124 aa4.73□□□□□ -1.65
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