RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 APLP1P51693 650 aa22.3■■□□□ 1.16
ZBED1-205ENST00000515319 USP54Q70EL1 1684 aa22.3■■□□□ 1.16
ZBED1-205ENST00000515319 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
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ZBED1-205ENST00000515319 USP31Q70CQ4 1352 aa22.27■■□□□ 1.16
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ZBED1-205ENST00000515319 C5P01031 1676 aa22.25■■□□□ 1.15
ZBED1-205ENST00000515319 NME9Q86XW9 330 aa22.24■■□□□ 1.15
ZBED1-205ENST00000515319 USP47Q96K76 1375 aa22.24■■□□□ 1.15
ZBED1-205ENST00000515319 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.22■■□□□ 1.15
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ZBED1-205ENST00000515319 CAPN15O75808 1086 aa22.2■■□□□ 1.14
ZBED1-205ENST00000515319 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.2■■□□□ 1.14
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ZBED1-205ENST00000515319 HTRA3P83110 453 aa22.05■■□□□ 1.12
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ZBED1-205ENST00000515319 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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ZBED1-205ENST00000515319 PXDNLA1KZ92 1463 aa22■■□□□ 1.11
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ZBED1-205ENST00000515319 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.91■■□□□ 1.1
ZBED1-205ENST00000515319 SIK1P57059 783 aa21.91■■□□□ 1.1
ZBED1-205ENST00000515319 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ZBED1-205ENST00000515319 PIGBQ92521 554 aa21.91■■□□□ 1.1
ZBED1-205ENST00000515319 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.9■■□□□ 1.1
ZBED1-205ENST00000515319 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.9■■□□□ 1.1
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