RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 GNAT3A8MTJ3 354 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 SSH2Q76I76 1423 aa13.83□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 GCC1Q96CN9 775 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKARQ7Z5J8 1434 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 IGSF1Q8N6C5 1336 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 NUCB1Q02818 461 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCC4O15439 1325 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 ORAI2Q96SN7 254 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 F6X3S4 739 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 KIAA0232Q92628 1395 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 USP19O94966 1318 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 G2E3Q7L622 706 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 IP6K1Q92551 441 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 PTPRCP08575 1304 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 DLG5Q8TDM6 1919 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC30Q5VVM6 783 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 TEFQ10587 303 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 MEIS3Q99687 375 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 NRKQ7Z2Y5 1582 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 PEAK1Q9H792 1746 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 NBPF4Q96M43 638 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 IL17REQ8NFR9 667 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 KDRP35968 1356 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 NFKBIBQ15653 356 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 CRB1P82279 1406 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 HMMRO75330 724 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 GCP02774 474 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 ATF3P18847 181 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 USP35Q9P2H5 1018 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP3K5Q99683 1374 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf141Q5JVX7 400 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 FLIIQ13045 1269 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 MSH6P52701 1360 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 BMP2KLQ5H9B9 411 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 DCTPP1Q9H773 170 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 PIK3C2AO00443 1686 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 CEP85Q6P2H3 762 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 LGR6Q9HBX8 967 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 HSCBQ8IWL3 235 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD24Q8TF21 1146 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 GNAI2P04899 355 aa13.71□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 GNAI3P08754 354 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 RTL1A6NKG5 1358 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 FMN2Q9NZ56 1722 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 BTBD11A6QL63 1104 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 CDC45O75419 566 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 CASC1Q6TDU7 716 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 AMOTQ4VCS5 1084 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 HSPA2P54652 639 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 ANXA1P04083 346 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-208ENST00000510829 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms