RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 RGPD5Q99666 1765 aa33.56■■■□□ 2.96
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HOXB3-212ENST00000498678 COL18A1P39060 1754 aa33.55■■■□□ 2.96
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HOXB3-212ENST00000498678 NHSL1Q5SYE7 1610 aa33.55■■■□□ 2.96
HOXB3-212ENST00000498678 CPDO75976 1380 aa33.54■■■□□ 2.96
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HOXB3-212ENST00000498678 WDR17Q8IZU2 1322 aa33.27■■■□□ 2.92
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HOXB3-212ENST00000498678 TEFQ10587 303 aa33.21■■■□□ 2.91
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HOXB3-212ENST00000498678 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
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HOXB3-212ENST00000498678 BTBD11A6QL63 1104 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXB3-212ENST00000498678 EVA1CP58658 441 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXB3-212ENST00000498678 STRN4Q9NRL3 753 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXB3-212ENST00000498678 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXB3-212ENST00000498678 IGHDP01880 384 aa33.13■■■□□ 2.89
HOXB3-212ENST00000498678 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
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