RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HLA-B-255ENST00000498007 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HLA-B-255ENST00000498007 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 SBF2Q86WG5 1849 aa26.63■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.63■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.62■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 TRIM37O94972 964 aa26.59■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 HMOX1P09601 288 aa26.59■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 KDRP35968 1356 aa26.58■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.58■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.58■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.58■■□□□ 1.85
HLA-B-255ENST00000498007 NHSQ6T4R5 1651 aa26.57■■□□□ 1.84
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC125Q86Z20 511 aa26.57■■□□□ 1.84
HLA-B-255ENST00000498007 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HLA-B-255ENST00000498007 BCL9O00512 1426 aa26.56■■□□□ 1.84
HLA-B-255ENST00000498007 SPG7Q9UQ90 795 aa26.56■■□□□ 1.84
HLA-B-255ENST00000498007 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.54■■□□□ 1.84
HLA-B-255ENST00000498007 NUDCQ9Y266 331 aa26.54■■□□□ 1.84
HLA-B-255ENST00000498007 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.53■■□□□ 1.84
HLA-B-255ENST00000498007 CYP27B1O15528 508 aa26.51■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.5■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.5■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.49■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 APBA3O96018 575 aa26.48■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 BAG6P46379 1132 aa26.48■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.48■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 BTAF1O14981 1849 aa26.47■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 KCNQ2O43526 872 aa26.47■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.47■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 PHKG2P15735 406 aa26.46■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.46■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HLA-B-255ENST00000498007 ANP32CO43423 234 aa26.45■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 PRKAR2BP31323 418 aa26.43■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.43■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.42■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.42■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 ITGB4P16144 1822 aa26.42■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 RREB1Q92766 1687 aa26.39■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HLA-B-255ENST00000498007 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 FCHSD2O94868 740 aa26.37■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.35■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.35■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.35■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.35■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.35■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.35■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 DCAF5Q96JK2 942 aa26.34■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.33■■□□□ 1.81
HLA-B-255ENST00000498007 PLSCR1O15162 318 aa26.32■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 NEFMP07197 916 aa26.31■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.31■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 MAP3K5Q99683 1374 aa26.31■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC184Q52MB2 194 aa26.3■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.29■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 LY75O60449 1722 aa26.29■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.29■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 PIGBQ92521 554 aa26.28■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.27■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 CABP4P57796 275 aa26.27■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.27■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HLA-B-255ENST00000498007 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.26■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 TXNRD1Q16881 649 aa26.26■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 LGR6Q9HBX8 967 aa26.26■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 MRS2Q9HD23 443 aa26.26■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.26■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 MRC1P22897 1456 aa26.25■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 PALLDQ8WX93 1383 aa26.24■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.24■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.24■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 PROM2Q8N271 834 aa26.23■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.21■■□□□ 1.79
HLA-B-255ENST00000498007 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
HLA-B-255ENST00000498007 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.2■■□□□ 1.78
HLA-B-255ENST00000498007 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.2■■□□□ 1.78
HLA-B-255ENST00000498007 PAPPAQ13219 1627 aa26.19■■□□□ 1.78
HLA-B-255ENST00000498007 NFE2L2Q16236 605 aa26.19■■□□□ 1.78
HLA-B-255ENST00000498007 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
HLA-B-255ENST00000498007 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
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