RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	SEC13	P55735	322 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	SSFA2	P28290	1259 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	WNT7A	O00755	349 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	FSHR	P23945	695 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	SLAIN2	Q9P270	581 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	SIAH2	O43255	324 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	RAB15	P59190	212 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	PSME1	Q06323	249 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115		M0R2N6	131 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	ADH1C	P00326	375 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	GRM5	P41594	1212 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	ATP2B4	P23634	1241 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	SLC19A1	P41440	591 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	SCTR	P47872	440 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	NR5A1	Q13285	461 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ETV1-223	ENST00000497115	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	10.32	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	OCLN	Q16625	522 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	CYLD	Q9NQC7	956 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115		A0A0G2JS52	829 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	MYT1	Q01538	1121 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	LILRA1	O75019	489 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	SCNN1D	P51172	638 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF358	Q9NW07	568 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	PRMT3	O60678	531 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	NR3C2	P08235	984 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	WEE1	P30291	646 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	BACH1	O14867	736 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	GDF10	P55107	478 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	GNRH1	P01148	92 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	HINFP	Q9BQA5	517 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	INHA	P05111	366 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC27	Q2M243	656 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	IGFBP4	P22692	258 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	ALDH1A1	P00352	501 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	EPHA4	P54764	986 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	NNT	Q13423	1086 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ETV1-223	ENST00000497115	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	FOXO3	O43524	673 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	SERPINB4	P48594	390 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	ADH1A	P07327	375 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	FOXC1	Q12948	553 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ETV1-223	ENST00000497115	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78

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