RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 SEMA3FQ13275 785 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PDCL3Q9H2J4 239 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 SPON1Q9HCB6 807 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 DLC1Q96QB1 1528 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 EVC2Q86UK5 1308 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NGEFQ8N5V2 710 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP6P59044 892 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 STK32BQ9NY57 414 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP7BP35670 1465 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM37O94972 964 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 DDB1Q16531 1140 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 BARGINQ6ZT62 677 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF11Q86T75 865 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PPLO60437 1756 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRB2O60241 1585 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 E9PSI1 815 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRNA2Q15822 529 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NUTM2GQ5VZR2 741 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 USP32Q8NFA0 1604 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 ACEP12821 1306 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC36A6NLP5 189 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 TULP4Q9NRJ4 1543 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0232Q92628 1395 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC5O00471 708 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 KNDC1Q76NI1 1749 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 YY1P25490 414 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP120Q8N960 986 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 FMN2Q9NZ56 1722 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 GCP02774 474 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNQ2O43526 872 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 POLD1P28340 1107 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 RINLQ6ZS11 566 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 BRD1O95696 1058 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 TMC1Q8TDI8 760 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 SSH2Q76I76 1423 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 MIER1Q8N108 512 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 CPDO75976 1380 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC7Q96M83 1385 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC96Q2M329 555 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 CABP2Q9NPB3 220 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 RALBP1Q15311 655 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 CABP1Q9NZU7 370 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 NINLQ9Y2I6 1382 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM182BQ5T319 152 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 POTEDQ86YR6 584 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 DISP2A7MBM2 1401 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR29P0C7W0 189 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 CRB1P82279 1406 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 GLI3P10071 1580 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 PLSCR1O15162 318 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-213ENST00000496055 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms