RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493016.1

TSC22D1-208, Transcript of TSC22 domain family member 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSC22D1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSC22D1-208ENST00000493016 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TSC22D1-208ENST00000493016 PAPPAQ13219 1627 aa22.64■■□□□ 1.21
TSC22D1-208ENST00000493016 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.62■■□□□ 1.21
TSC22D1-208ENST00000493016 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.62■■□□□ 1.21
TSC22D1-208ENST00000493016 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.62■■□□□ 1.21
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TSC22D1-208ENST00000493016 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.6■■□□□ 1.21
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TSC22D1-208ENST00000493016 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TSC22D1-208ENST00000493016 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.58■■□□□ 1.21
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TSC22D1-208ENST00000493016 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.54■■□□□ 1.2
TSC22D1-208ENST00000493016 ZNF827Q17R98 1081 aa22.53■■□□□ 1.2
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TSC22D1-208ENST00000493016 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.53■■□□□ 1.2
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TSC22D1-208ENST00000493016 ITGB4P16144 1822 aa22.5■■□□□ 1.19
TSC22D1-208ENST00000493016 PANK3Q9H999 370 aa22.49■■□□□ 1.19
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TSC22D1-208ENST00000493016 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.46■■□□□ 1.19
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TSC22D1-208ENST00000493016 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSC22D1-208ENST00000493016 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.44■■□□□ 1.18
TSC22D1-208ENST00000493016 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.44■■□□□ 1.18
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TSC22D1-208ENST00000493016 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.43■■□□□ 1.18
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TSC22D1-208ENST00000493016 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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TSC22D1-208ENST00000493016 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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TSC22D1-208ENST00000493016 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.27■■□□□ 1.16
TSC22D1-208ENST00000493016 SIK1P57059 783 aa22.27■■□□□ 1.16
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TSC22D1-208ENST00000493016 KLHL34Q8N239 644 aa22.27■■□□□ 1.16
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TSC22D1-208ENST00000493016 DCAF5Q96JK2 942 aa22.24■■□□□ 1.15
TSC22D1-208ENST00000493016 MSL1Q68DK7 614 aa22.23■■□□□ 1.15
TSC22D1-208ENST00000493016 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TSC22D1-208ENST00000493016 ATG3Q9NT62 314 aa22.23■■□□□ 1.15
TSC22D1-208ENST00000493016 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TSC22D1-208ENST00000493016 IL13P35225 146 aa22.22■■□□□ 1.15
TSC22D1-208ENST00000493016 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.22■■□□□ 1.15
TSC22D1-208ENST00000493016 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.22■■□□□ 1.15
TSC22D1-208ENST00000493016 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.22■■□□□ 1.15
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