RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490751.1

LDB1-204, Transcript of LIM domain binding 1, human

TSL 2

Gene LDB1, Length 762 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LDB1-204	ENST00000490751	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	43.2	■■■■■ 4.51
LDB1-204	ENST00000490751	PROM2	Q8N271	834 aa		43.2	■■■■■ 4.51
LDB1-204	ENST00000490751	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	43.18	■■■■■ 4.5
LDB1-204	ENST00000490751	TXNRD1	Q16881	649 aa		43.16	■■■■■ 4.5
LDB1-204	ENST00000490751	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		43.16	■■■■■ 4.5
LDB1-204	ENST00000490751	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
LDB1-204	ENST00000490751	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		43.14	■■■■■ 4.5
LDB1-204	ENST00000490751	POLK	Q9UBT6	870 aa		43.13	■■■■■ 4.49
LDB1-204	ENST00000490751	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
LDB1-204	ENST00000490751	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		43.12	■■■■■ 4.49
LDB1-204	ENST00000490751	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	43.11	■■■■■ 4.49
LDB1-204	ENST00000490751	NSD2	O96028	1365 aa		43.1	■■■■■ 4.49
LDB1-204	ENST00000490751	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		43.09	■■■■■ 4.49
LDB1-204	ENST00000490751	NCAPD2	Q15021	1401 aa		43.05	■■■■■ 4.48
LDB1-204	ENST00000490751	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	43.02	■■■■■ 4.48
LDB1-204	ENST00000490751	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	43.01	■■■■■ 4.48
LDB1-204	ENST00000490751	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		43.01	■■■■■ 4.48
LDB1-204	ENST00000490751	CASZ1	Q86V15	1759 aa		43	■■■■■ 4.47
LDB1-204	ENST00000490751	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		43	■■■■■ 4.47
LDB1-204	ENST00000490751	STK32B	Q9NY57	414 aa		42.99	■■■■■ 4.47
LDB1-204	ENST00000490751	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LDB1-204	ENST00000490751	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LDB1-204	ENST00000490751	EYA1	Q99502	592 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LDB1-204	ENST00000490751	PAPPA	Q13219	1627 aa		42.97	■■■■■ 4.47
LDB1-204	ENST00000490751	MORC1	Q86VD1	984 aa		42.97	■■■■■ 4.47
LDB1-204	ENST00000490751	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
LDB1-204	ENST00000490751	SLC15A2	Q16348	729 aa		42.94	■■■■■ 4.46
LDB1-204	ENST00000490751	SPON1	Q9HCB6	807 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LDB1-204	ENST00000490751	LY75	O60449	1722 aa		42.89	■■■■■ 4.46
LDB1-204	ENST00000490751	CYP27B1	O15528	508 aa		42.89	■■■■■ 4.46
LDB1-204	ENST00000490751	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
LDB1-204	ENST00000490751	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		42.89	■■■■■ 4.46
LDB1-204	ENST00000490751	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
LDB1-204	ENST00000490751	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		42.85	■■■■■ 4.45
LDB1-204	ENST00000490751	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		42.85	■■■■■ 4.45
LDB1-204	ENST00000490751	SPG7	Q9UQ90	795 aa		42.84	■■■■■ 4.45
LDB1-204	ENST00000490751	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LDB1-204	ENST00000490751	ZNF827	Q17R98	1081 aa		42.8	■■■■■ 4.44
LDB1-204	ENST00000490751	ITGB4	P16144	1822 aa		42.8	■■■■■ 4.44
LDB1-204	ENST00000490751	ZBTB7A	O95365	584 aa		42.79	■■■■■ 4.44
LDB1-204	ENST00000490751	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	42.79	■■■■■ 4.44
LDB1-204	ENST00000490751	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
LDB1-204	ENST00000490751	KCNQ4	P56696	695 aa		42.77	■■■■■ 4.44
LDB1-204	ENST00000490751	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
LDB1-204	ENST00000490751	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
LDB1-204	ENST00000490751	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		42.74	■■■■■ 4.43
LDB1-204	ENST00000490751	AKT1S1	Q96B36	256 aa		42.73	■■■■■ 4.43
LDB1-204	ENST00000490751	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
LDB1-204	ENST00000490751	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		42.73	■■■■■ 4.43
LDB1-204	ENST00000490751	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		42.72	■■■■■ 4.43
LDB1-204	ENST00000490751	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
LDB1-204	ENST00000490751	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		42.69	■■■■■ 4.43
LDB1-204	ENST00000490751	PHKG2	P15735	406 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LDB1-204	ENST00000490751	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
LDB1-204	ENST00000490751	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LDB1-204	ENST00000490751	MTFR1L	Q9H019	292 aa		42.67	■■■■■ 4.42
LDB1-204	ENST00000490751	PALLD	Q8WX93	1383 aa		42.66	■■■■■ 4.42
LDB1-204	ENST00000490751	PTGER2	P43116	358 aa		42.64	■■■■■ 4.42
LDB1-204	ENST00000490751	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		42.63	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	C5	P01031	1676 aa		42.63	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	IL13	P35225	146 aa		42.62	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	MTHFS	P49914	203 aa		42.62	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	PIGB	Q92521	554 aa		42.62	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		42.61	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		42.61	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		42.59	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		42.59	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		42.58	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LDB1-204	ENST00000490751	KDR	P35968	1356 aa		42.56	■■■■■ 4.4
LDB1-204	ENST00000490751	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
LDB1-204	ENST00000490751	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		42.55	■■■■■ 4.4
LDB1-204	ENST00000490751	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		42.55	■■■■■ 4.4
LDB1-204	ENST00000490751	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
LDB1-204	ENST00000490751	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		42.51	■■■■■ 4.4
LDB1-204	ENST00000490751	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
LDB1-204	ENST00000490751	DCAF5	Q96JK2	942 aa		42.48	■■■■■ 4.39
LDB1-204	ENST00000490751	C4B	P0C0L5	1744 aa		42.47	■■■■■ 4.39
LDB1-204	ENST00000490751	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
LDB1-204	ENST00000490751	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		42.47	■■■■■ 4.39
LDB1-204	ENST00000490751	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
LDB1-204	ENST00000490751	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		42.46	■■■■■ 4.39
LDB1-204	ENST00000490751	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		42.44	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		42.44	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		42.43	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	SIK1	P57059	783 aa		42.43	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	ARX	Q96QS3	562 aa		42.42	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	ATG3	Q9NT62	314 aa		42.42	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	HMOX1	P09601	288 aa		42.41	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	MSH5	O43196	834 aa		42.4	■■■■■ 4.38
LDB1-204	ENST00000490751	AK7	Q96M32	723 aa		42.37	■■■■■ 4.37
LDB1-204	ENST00000490751	POLD1	P28340	1107 aa		42.36	■■■■■ 4.37
LDB1-204	ENST00000490751	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		42.36	■■■■■ 4.37
LDB1-204	ENST00000490751	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		42.35	■■■■■ 4.37

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