RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	FUT2	Q10981	343 aa		7.38	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.38	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.38	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	KANK1	Q14678	1352 aa		7.37	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		7.37	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	SEMA3E	O15041	775 aa		7.37	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	THAP11	Q96EK4	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	ABCC3	O15438	1527 aa		7.37	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	ERVK-7	P63135	1459 aa		7.36	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		7.36	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		7.36	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	SULF1	Q8IWU6	871 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	KIFC2	Q96AC6	838 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	GNPAT	O15228	680 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBP1-210	ENST00000486388	KIF15	Q9NS87	1388 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	CEP152	O94986	1710 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	GCGR	P47871	477 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	SLIT1	O75093	1534 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	LTK	P29376	864 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	MSS51	Q4VC12	460 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	BRICD5	Q6PL45	260 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM47	Q96LD4	638 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	WNT7A	O00755	349 aa		7.31	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	FECH	P22830	423 aa		7.31	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		7.31	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		7.31	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		7.31	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		7.31	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		7.3	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	KCNA6	P17658	529 aa		7.3	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	NLRP7	Q8WX94	980 aa		7.3	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		7.3	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	MSH6	P52701	1360 aa		7.3	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	ALK	Q9UM73	1620 aa		7.3	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM32	Q13049	653 aa		7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388		Q3C1V9	767 aa		7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM94	Q12767	1356 aa		7.29	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	PIK3C2B	O00750	1634 aa		7.28	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	SMPD1	P17405	629 aa		7.28	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	IDI1	Q13907	227 aa		7.28	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.28	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		7.28	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	DAPK1	P53355	1430 aa		7.27	□□□□□ -1.24
UBP1-210	ENST00000486388	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		7.27	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		7.27	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.27	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.27	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	ABCC5	O15440	1437 aa		7.27	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		7.26	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	JCAD	Q9P266	1359 aa		7.26	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	GPR37	O15354	613 aa		7.26	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.26	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		7.25	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388		J3QL48	77 aa		7.25	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	ATF3	P18847	181 aa		7.25	□□□□□ -1.25
UBP1-210	ENST00000486388	MMP16	P51512	607 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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