RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 USP6P35125 1406 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 FAM83GA6ND36 823 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 LAMC1P11047 1609 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 GNAI2P04899 355 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 PIK3C2BO00750 1634 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 DEPDC5O75140 1603 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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PTPRD-211ENST00000486161 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.23□□□□□ -0.77
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PTPRD-211ENST00000486161 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.23□□□□□ -0.77
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PTPRD-211ENST00000486161 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
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PTPRD-211ENST00000486161 PTCH1Q13635 1447 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRD-211ENST00000486161 MAP3K5Q99683 1374 aa10.21□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.21□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 BRINP3Q76B58 766 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 HSCBQ8IWL3 235 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 DLC1Q96QB1 1528 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa10.18□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 NBPF4Q96M43 638 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.18□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.17□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM57Q8N5G2 664 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 ZPR1O75312 459 aa10.17□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.16□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 FAM161AQ3B820 660 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-211ENST00000486161 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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PTPRD-211ENST00000486161 TECPR2O15040 1411 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-211ENST00000486161 REC8O95072 547 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM27P14373 513 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-211ENST00000486161 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-211ENST00000486161 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-211ENST00000486161 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.13□□□□□ -0.79
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