RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.63■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.63■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF4Q96M43 638 aa23.63■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 MTFR1LQ9H019 292 aa23.63■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.62■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.61■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.6■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 YY1P25490 414 aa23.6■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.6■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 INSRP06213 1382 aa23.6■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.59■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.59■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 FLT4P35916 1363 aa23.59■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 AKT1S1Q96B36 256 aa23.58■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SKIV2L-211ENST00000485349 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.57■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNQ4P56696 695 aa23.57■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.56■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.56■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.56■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.55■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.55■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.55■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.55■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 SYT17Q9BSW7 474 aa23.54■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.54■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.53■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.53■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 ARXQ96QS3 562 aa23.52■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.52■■□□□ 1.36
SKIV2L-211ENST00000485349 C5P01031 1676 aa23.51■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGB4P16144 1822 aa23.51■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.51■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.51■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 NCAPD2Q15021 1401 aa23.5■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.49■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP3K5Q99683 1374 aa23.49■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.48■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.46■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 CHD4Q14839 1912 aa23.45■■□□□ 1.35
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP27B1O15528 508 aa23.45■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.45■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 PALLDQ8WX93 1383 aa23.42■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.42■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 POLD1P28340 1107 aa23.41■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.41■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHL34Q8N239 644 aa23.4■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 POLKQ9UBT6 870 aa23.4■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 C4BP0C0L5 1744 aa23.39■■□□□ 1.34
SKIV2L-211ENST00000485349 EYA1Q99502 592 aa23.39■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 MSH5O43196 834 aa23.37■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.36■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 SPG7Q9UQ90 795 aa23.35■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 MSL1Q68DK7 614 aa23.34■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.34■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 PIGBQ92521 554 aa23.34■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR162Q16538 588 aa23.32■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 PANK3Q9H999 370 aa23.31■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.324e-7■□□□□ 10.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PHKG2P15735 406 aa23.3■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.3■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 AK7Q96M32 723 aa23.28■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.28■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.28■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.27■■□□□ 1.32
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.27■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.26■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 SIK1P57059 783 aa23.26■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 SMIM5Q71RC9 77 aa23.26■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.26■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 PHF14O94880 888 aa23.25■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.25■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.25■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 ITPK1Q13572 414 aa23.22■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 ATG3Q9NT62 314 aa23.21■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.21■■□□□ 1.31
SKIV2L-211ENST00000485349 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 KDRP35968 1356 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms