RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
CHKB-210ENST00000484266 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
CHKB-210ENST00000484266 KDRP35968 1356 aa44.25■■■■■ 4.67
CHKB-210ENST00000484266 AEBP1Q8IUX7 1158 aa44.24■■■■■ 4.67
CHKB-210ENST00000484266 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
CHKB-210ENST00000484266 SULT6B1Q6IMI4 303 aa44.23■■■■■ 4.67
CHKB-210ENST00000484266 SBF2Q86WG5 1849 aa44.22■■■■■ 4.67
CHKB-210ENST00000484266 BCL9O00512 1426 aa44.2■■■■■ 4.67
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa44.19■■■■■ 4.66
CHKB-210ENST00000484266 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
CHKB-210ENST00000484266 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
CHKB-210ENST00000484266 HMOX1P09601 288 aa44.15■■■■■ 4.66
CHKB-210ENST00000484266 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
CHKB-210ENST00000484266 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP44.14■■■■■ 4.663e-8■□□□□ 11.2
CHKB-210ENST00000484266 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa44.13■■■■■ 4.66
CHKB-210ENST00000484266 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa44.13■■■■■ 4.66
CHKB-210ENST00000484266 CCDC125Q86Z20 511 aa44.13■■■■■ 4.65
CHKB-210ENST00000484266 SPG7Q9UQ90 795 aa44.11■■■■■ 4.65
CHKB-210ENST00000484266 NUDCQ9Y266 331 aa44.11■■■■■ 4.65
CHKB-210ENST00000484266 TRIM37O94972 964 aa44.1■■■■■ 4.65
CHKB-210ENST00000484266 CYP27B1O15528 508 aa44.07■■■■■ 4.65
CHKB-210ENST00000484266 NHSQ6T4R5 1651 aa44.05■■■■■ 4.64
CHKB-210ENST00000484266 DOT1LQ8TEK3 1739 aa44.04■■■■■ 4.64
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
CHKB-210ENST00000484266 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
CHKB-210ENST00000484266 KAT6BQ8WYB5 2073 aa44.02■■■■■ 4.64
CHKB-210ENST00000484266 AMOTQ4VCS5 1084 aa44.01■■■■■ 4.64
CHKB-210ENST00000484266 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP44■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 ANP32CO43423 234 aa43.99■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 ACSBG1Q96GR2 724 aa43.99■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 PTF1AQ7RTS3 328 aa43.99■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 RSPH6AQ9H0K4 717 aa43.98■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 PHKG2P15735 406 aa43.97■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 IFNL2Q8IZJ0 200 aa43.97■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 KCNQ2O43526 872 aa43.96■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa43.96■■■■■ 4.63
CHKB-210ENST00000484266 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
CHKB-210ENST00000484266 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
CHKB-210ENST00000484266 DEFB132Q7Z7B7 95 aa43.93■■■■■ 4.62
CHKB-210ENST00000484266 PRKAR2BP31323 418 aa43.91■■■■■ 4.62
CHKB-210ENST00000484266 BTAF1O14981 1849 aa43.91■■■■■ 4.62
CHKB-210ENST00000484266 FCHSD2O94868 740 aa43.9■■■■■ 4.62
CHKB-210ENST00000484266 APBA3O96018 575 aa43.9■■■■■ 4.62
CHKB-210ENST00000484266 BAG6P46379 1132 aa43.9■■■■■ 4.62
CHKB-210ENST00000484266 ITGB4P16144 1822 aa43.88■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 C1orf141Q5JVX7 400 aa43.85■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 PHACTR3Q96KR7 559 aa43.83■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa43.83■■■■■ 4.61
CHKB-210ENST00000484266 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 AKAP4Q5JQC9 854 aa43.81■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 CCDC184Q52MB2 194 aa43.8■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 DCAF5Q96JK2 942 aa43.8■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 SCN11AQ9UI33 1791 aa43.79■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 CAMKK2Q96RR4 588 aa43.78■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 GAS2L2Q8NHY3 880 aa43.77■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 PLSCR1O15162 318 aa43.76■■■■■ 4.6
CHKB-210ENST00000484266 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHF1Q96S99 279 aa43.75■■■■■ 4.59
CHKB-210ENST00000484266 RREB1Q92766 1687 aa43.75■■■■■ 4.59
CHKB-210ENST00000484266 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa43.74■■■■■ 4.59
CHKB-210ENST00000484266 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.59
CHKB-210ENST00000484266 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa43.73■■■■■ 4.59
CHKB-210ENST00000484266 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
CHKB-210ENST00000484266 ERVV-2B6SEH9 535 aa43.7■■■■■ 4.59
CHKB-210ENST00000484266 MAP3K5Q99683 1374 aa43.69■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 PIGBQ92521 554 aa43.67■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 TMOD3Q9NYL9 352 aa43.67■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 ADAMTS8Q9UP79 889 aa43.67■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 NEFMP07197 916 aa43.66■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 NUP188Q5SRE5 1749 aa43.66■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 LGR6Q9HBX8 967 aa43.65■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 MRS2Q9HD23 443 aa43.65■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 LY75O60449 1722 aa43.65■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 DLG5Q8TDM6 1919 aa43.65■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 GNAT3A8MTJ3 354 aa43.65■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 RNMTO43148 476 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
CHKB-210ENST00000484266 PROM2Q8N271 834 aa43.63■■■■■ 4.57
CHKB-210ENST00000484266 MRC1P22897 1456 aa43.62■■■■■ 4.57
CHKB-210ENST00000484266 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa43.62■■■■■ 4.57
CHKB-210ENST00000484266 CABP4P57796 275 aa43.61■■■■■ 4.57
CHKB-210ENST00000484266 TXNRD1Q16881 649 aa43.59■■■■■ 4.57
CHKB-210ENST00000484266 CCDC146Q8IYE0 955 aa43.57■■■■■ 4.57
CHKB-210ENST00000484266 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 IL17REQ8NFR9 667 aa43.56■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 NFE2L2Q16236 605 aa43.56■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa43.56■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 SLC52A2Q9HAB3 445 aa43.55■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 PALLDQ8WX93 1383 aa43.54■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 RUNDC1Q96C34 613 aa43.54■■■■■ 4.56
CHKB-210ENST00000484266 ASAP1Q9ULH1 1129 aa43.53■■■■■ 4.56
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