RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479263.5

PRKCZ-215, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 1,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-215	ENST00000479263	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	CRB1	P82279	1406 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAP3K5	Q99683	1374 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	LRRC37A3	O60309	1634 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.07
PRKCZ-215	ENST00000479263	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	CHL1	O00533	1208 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	TSPYL6	Q8N831	410 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	MEGF6	O75095	1541 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PRKCZ-215	ENST00000479263	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	VAMP4	O75379	141 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	LGR6	Q9HBX8	967 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	STRN4	Q9NRL3	753 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-215	ENST00000479263	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	CERK	Q8TCT0	537 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	BTG4	Q9NY30	223 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	EVA1C	P58658	441 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	TNN	Q9UQP3	1299 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZNF428	Q96B54	188 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	PANK1	Q8TE04	598 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	SPG7	Q9UQ90	795 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	ADAMTS2	O95450	1211 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	RLBP1	P12271	317 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	PHKG2	P15735	406 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	CYP27B1	O15528	508 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	TEF	Q10587	303 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIF16B	Q96L93	1317 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	TRIM27	P14373	513 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	IL2RB	P14784	551 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	USP35	Q9P2H5	1018 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-215	ENST00000479263	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-215	ENST00000479263	NRAP	Q86VF7	1730 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PRKCZ-215	ENST00000479263	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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