RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC102BQ68D86 513 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-207ENST00000470201 PSME1Q06323 249 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-207ENST00000470201 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-207ENST00000470201 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.9□□□□□ -1.14
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RABGGTB-207ENST00000470201 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 SFI1A8K8P3 1242 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGGTB-207ENST00000470201 M0R2N6 131 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 PRMT3O60678 531 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPINB4P48594 390 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGGTB-207ENST00000470201 RPIAP49247 311 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 SKOR1P84550 965 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZNB5 142 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM52Q96A61 297 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-207ENST00000470201 ERCC3P19447 782 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVK-9P63128 1117 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF428Q96B54 188 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.82□□□□□ -1.16
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RABGGTB-207ENST00000470201 SCTRP47872 440 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 LAPTM4AQ15012 233 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 HINFPQ9BQA5 517 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 GFRA3O60609 400 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 FSHRP23945 695 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 WEE1P30291 646 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGGTB-207ENST00000470201 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
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RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF358Q9NW07 568 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGGTB-207ENST00000470201 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
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RABGGTB-207ENST00000470201 E9PSI1 815 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 H3BRB1 525 aa7.78□□□□□ -1.16
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RABGGTB-207ENST00000470201 ABL1P00519 1130 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 IGFBP4P22692 258 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 SCNN1DP51172 638 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 ARID5BQ14865 1188 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 COL26A1Q96A83 441 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-207ENST00000470201 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.78□□□□□ -1.16
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RABGGTB-207ENST00000470201 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.78□□□□□ -1.16
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RABGGTB-207ENST00000470201 ICMTO60725 284 aa7.77□□□□□ -1.17
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RABGGTB-207ENST00000470201 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.76□□□□□ -1.17
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RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 MYT1Q01538 1121 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
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