RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, human

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OPN3-204	ENST00000469376	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.45	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.44	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	PSME1	Q06323	249 aa		32.43	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		32.43	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	LNPK	Q9C0E8	428 aa		32.43	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.43	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	FOXO3	O43524	673 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	HSCB	Q8IWL3	235 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OPN3-204	ENST00000469376	SNX21	Q969T3	373 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		32.36	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.33	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.33	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.33	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	MCM4	P33991	863 aa		32.32	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.32	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.32	■■■□□ 2.77
OPN3-204	ENST00000469376	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.31	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	USP31	Q70CQ4	1352 aa		32.31	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.3	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		32.29	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.29	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.29	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	NLRP6	P59044	892 aa		32.28	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		32.28	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
OPN3-204	ENST00000469376	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.26	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.25	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	DDIT3	P35638	169 aa		32.24	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	KIAA0232	Q92628	1395 aa		32.22	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		32.2	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		32.2	■■■□□ 2.75
OPN3-204	ENST00000469376	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.19	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.19	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.19	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.19	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	PXDN	Q92626	1479 aa		32.18	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	CHL1	O00533	1208 aa		32.18	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	CDC45	O75419	566 aa		32.18	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.18	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.18	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	DCTPP1	Q9H773	170 aa		32.18	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	SOX12	O15370	315 aa		32.17	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	KIF2C	Q99661	725 aa		32.16	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.16	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		32.16	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	RGS12	O14924	1447 aa		32.15	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	PTPRC	P08575	1304 aa		32.14	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.14	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		32.14	■■■□□ 2.74
OPN3-204	ENST00000469376	TRAK2	O60296	914 aa		32.13	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	FSD2	A1L4K1	749 aa		32.12	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.12	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		32.12	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.12	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		32.11	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.11	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.1	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.1	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	TOM1	O60784	492 aa		32.08	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.08	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	CRB1	P82279	1406 aa		32.08	■■■□□ 2.73
OPN3-204	ENST00000469376	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.07	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		32.07	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	PTMS	P20962	102 aa		32.07	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	TTC22	Q5TAA0	569 aa		32.07	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.06	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	GBP4	Q96PP9	640 aa		32.06	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		32.05	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	MCM10	Q7L590	875 aa		32.05	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.05	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	GC	P02774	474 aa		32.04	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	CEP85	Q6P2H3	762 aa		32.04	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	SLIT3	O75094	1523 aa		32.04	■■■□□ 2.72

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