RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 ZNF428Q96B54 188 aa21.76■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 FANCAO15360 1455 aa21.76■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 GNAI1P63096 354 aa21.75■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.75■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 CABP1Q9NZU7 370 aa21.75■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 POLKQ9UBT6 870 aa21.75■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 USP25Q9UHP3 1055 aa21.75■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 NPATQ14207 1427 aa21.75■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 CASC1Q6TDU7 716 aa21.74■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 PALD1Q9ULE6 856 aa21.74■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.74■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 PPLO60437 1756 aa21.74■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 CEP85Q6P2H3 762 aa21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 PRAM1Q96QH2 718 aa21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 CHD1O14646 1710 aa21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 ERC2O15083 957 aa21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 IFT57Q9NWB7 429 aa21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.73■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.72■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 REC8O95072 547 aa21.72■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 MBD3O95983 291 aa21.72■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 MEIS3Q99687 375 aa21.72■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 DTNBO60941 627 aa21.72■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 BRD1O95696 1058 aa21.72■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 ZNF853P0CG23 659 aa21.71■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.71■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 PLCB2Q00722 1185 aa21.7■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.69■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 USP48Q86UV5 1035 aa21.69■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 ATP2B3Q16720 1220 aa21.69■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.69■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 ATP10DQ9P241 1426 aa21.69■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.68■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 PDE4CQ08493 712 aa21.67■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 CFAP44Q96MT7 982 aa21.67■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 ADCY5O95622 1261 aa21.67■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 DMTNQ08495 405 aa21.67■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.67■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 CDK19Q9BWU1 502 aa21.66■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 MSH6P52701 1360 aa21.66■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.66■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 IGSF3O75054 1194 aa21.65■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.65■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 PDE1AP54750 535 aa21.64■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.64■■□□□ 1.06
PREB-208ENST00000468045 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.64■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 RTL1A6NKG5 1358 aa21.63■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 REREQ9P2R6 1566 aa21.63■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.62■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 RILPL2Q969X0 211 aa21.62■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 IL13P35225 146 aa21.62■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.62■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 TCHHQ07283 1943 aa21.62■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 F6X3S4 739 aa21.61■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 CUL4AQ13619 759 aa21.61■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.61■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 IDI1Q13907 227 aa21.61■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.6■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.6■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.6■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 KIF3AQ9Y496 699 aa21.6■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 AP5Z1O43299 807 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 NME9Q86XW9 330 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 RGS12O14924 1447 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 MCM10Q7L590 875 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 SPC24Q8NBT2 197 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 IL25Q9H293 177 aa21.59■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 ABCC3O15438 1527 aa21.58■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.58■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.58■■□□□ 1.05
PREB-208ENST00000468045 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.58■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.57■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.57■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.57■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 PHF14O94880 888 aa21.56■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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