RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ATRNO75882 1429 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RGPD2P0DJD1 1756 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.434e-6■■□□□ 11.5
SH3BP4-208ENST00000462602 LMOD3Q0VAK6 560 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 NFE2L2Q16236 605 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOC5O00471 708 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RIPK4P57078 832 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 MEGF6O75095 1541 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 NEUROD2Q15784 382 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 DISP2A7MBM2 1401 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC27Q2M243 656 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-208ENST00000462602 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 DDB1Q16531 1140 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP3K5Q99683 1374 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0G2JS52 829 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 RXRBP28702 533 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 MYT1Q01538 1121 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PHKG2P15735 406 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 WWC1Q8IX03 1113 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TNS2Q63HR2 1409 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP27B1O15528 508 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE3BQ13370 1112 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR63Q8IWG1 891 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SEPT12Q8IYM1 358 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GLI3P10071 1580 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF5Q96JK2 942 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PKD1L3Q7Z443 1732 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF521Q96K83 1311 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA2Q08379 1002 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 POTEAQ6S8J7 498 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 MCM10Q7L590 875 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 IL17REQ8NFR9 667 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 IL16Q14005 1332 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 TEFQ10587 303 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 DCTN1Q14203 1278 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LGR6Q9HBX8 967 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 ERVV-2B6SEH9 535 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 E9PSI1 815 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT57Q9NWB7 429 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC37A3O60309 1634 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 CABP4P57796 275 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 GNAI1P63096 354 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT27Q7Z3Y8 459 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP44Q96MT7 982 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 BABAM1Q9NWV8 329 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 DLG5Q8TDM6 1919 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF853P0CG23 659 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SLFN5Q08AF3 891 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL9O00512 1426 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 BTBD11A6QL63 1104 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 CHL1O00533 1208 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM196AQ6ZSG2 479 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.2□□□□□ -0.46
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