RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 STK17AQ9UEE5 414 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 LRP6O75581 1613 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 JCADQ9P266 1359 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPRNQ16849 979 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 SYNMO15061 1565 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 C1QTNF8P60827 252 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 BMP1P13497 986 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNH2Q12809 1159 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC01559Q495D7 138 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR7Q8TB68 274 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 BAP1Q92560 729 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 MTMR2Q13614 643 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 LCE2CQ5TA81 110 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 BARGINQ6ZT62 677 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 AGLP35573 1532 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 ZMYM3Q14202 1370 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 PHLPP1O60346 1717 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 MROH2AA6NES4 1674 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 ZMYND10O75800 440 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 AMHR2Q16671 573 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 DESI1Q6ICB0 168 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF511Q8NB15 262 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 AFF2P51816 1311 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGGTB-203ENST00000459697 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 HRCP23327 699 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 CTHP32929 405 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF27Q86VH2 1401 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGGTB-203ENST00000459697 NNTQ13423 1086 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC125Q86Z20 511 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 MPNDQ8N594 471 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP42Q96MM3 310 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 IQGAP1P46940 1657 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 KDM5CP41229 1560 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 LYPD8Q6UX82 237 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 IRF7Q92985 503 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCA6Q8N139 1617 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 VEGFBP49765 207 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA3Q08378 1498 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 GMPRP36959 345 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SCARF1Q14162 830 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 AFAP1Q8N556 730 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 NGLY1Q96IV0 654 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 MED14O60244 1454 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCC1P33527 1531 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 NWD1Q149M9 1564 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 CFAP99D6REC4 459 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 H3BM21 787 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 SPTLC1O15269 473 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 ADH1CP00326 375 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 ARID5BQ14865 1188 aa8.45□□□□□ -1.06
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