RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF16B	Q96L93	1317 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUCB2	P80303	420 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PSEN1	P49768	467 aa		12.75	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADGRB1	O14514	1584 aa		12.75	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AK9	Q5TCS8	1911 aa		12.75	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.75	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		12.75	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		12.74	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.74	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		12.74	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		12.74	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSPY26P	Q9H489	355 aa		12.73	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	YY1AP1	Q9H869	796 aa		12.73	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		12.73	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		12.72	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		12.72	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF18A	Q8NI77	898 aa		12.72	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		12.72	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.71	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EFCC1	Q9HA90	598 aa		12.71	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP25	Q9UHP3	1055 aa		12.71	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		12.71	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		12.71	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT222	Q8N1A0	295 aa		12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADCY5	O95622	1261 aa		12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APP	P05067	770 aa		12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TESK2	Q96S53	571 aa		12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLGN	O14967	610 aa		12.69	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WWC1	Q8IX03	1113 aa		12.69	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		12.69	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DIP2A	Q14689	1571 aa		12.69	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	12.69	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYCP1	Q15431	976 aa		12.68	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		12.68	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.68	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRR29	P0C7W0	189 aa		12.68	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		12.68	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		12.68	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDCA8	Q53HL2	280 aa		12.67	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MED14	O60244	1454 aa		12.67	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MBD3	O95983	291 aa		12.67	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ST7	Q9NRC1	585 aa		12.67	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		12.67	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UVSSA	Q2YD98	709 aa		12.66	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LNPK	Q9C0E8	428 aa		12.66	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		12.66	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DLC1	Q96QB1	1528 aa		12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMX1	Q9H3N1	280 aa		12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP2C19	P33261	490 aa		12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	12.65	□□□□□ -0.38
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIRT1	Q96EB6	747 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMF1	P82094	1093 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUCB1	Q02818	461 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEUROD2	Q15784	382 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNPY4	Q8N129	248 aa		12.64	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM193A	P78312	1265 aa		12.63	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.63	□□□□□ -0.39
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39

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