RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
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UBXN4-204ENST00000426921 NSD2O96028 1365 aa28.9■■■□□ 2.22
UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
UBXN4-204ENST00000426921 NCAPD2Q15021 1401 aa28.88■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.88■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.88■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.88■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.87■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.87■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.87■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB7AO95365 584 aa28.86■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 PTGER2P43116 358 aa28.86■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
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UBXN4-204ENST00000426921 LY75O60449 1722 aa28.85■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
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UBXN4-204ENST00000426921 ZNF827Q17R98 1081 aa28.83■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 MTFR1LQ9H019 292 aa28.83■■■□□ 2.21
UBXN4-204ENST00000426921 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.83■■■□□ 2.21
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UBXN4-204ENST00000426921 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.81■■■□□ 2.2
UBXN4-204ENST00000426921 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.81■■■□□ 2.2
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UBXN4-204ENST00000426921 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.81■■■□□ 2.2
UBXN4-204ENST00000426921 AKT1S1Q96B36 256 aa28.81■■■□□ 2.2
UBXN4-204ENST00000426921 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.8■■■□□ 2.2
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UBXN4-204ENST00000426921 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.76■■■□□ 2.19
UBXN4-204ENST00000426921 POLKQ9UBT6 870 aa28.76■■■□□ 2.19
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UBXN4-204ENST00000426921 CYP27B1O15528 508 aa28.74■■■□□ 2.19
UBXN4-204ENST00000426921 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.74■■■□□ 2.19
UBXN4-204ENST00000426921 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.73■■■□□ 2.19
UBXN4-204ENST00000426921 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.72■■■□□ 2.19
UBXN4-204ENST00000426921 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.71■■■□□ 2.19
UBXN4-204ENST00000426921 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.7■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 EYA1Q99502 592 aa28.7■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 PANK3Q9H999 370 aa28.7■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.7■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 KCNQ4P56696 695 aa28.69■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 MAP3K5Q99683 1374 aa28.68■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.182e-8■□□□□ 11.1
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UBXN4-204ENST00000426921 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.66■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 ITGB4P16144 1822 aa28.65■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.65■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
UBXN4-204ENST00000426921 ARXQ96QS3 562 aa28.65■■■□□ 2.18
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UBXN4-204ENST00000426921 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
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UBXN4-204ENST00000426921 C4BP0C0L5 1744 aa28.54■■■□□ 2.16
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UBXN4-204ENST00000426921 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.5■■■□□ 2.15
UBXN4-204ENST00000426921 KDRP35968 1356 aa28.47■■■□□ 2.15
UBXN4-204ENST00000426921 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.46■■■□□ 2.15
UBXN4-204ENST00000426921 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.46■■■□□ 2.15
UBXN4-204ENST00000426921 SIK1P57059 783 aa28.46■■■□□ 2.15
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UBXN4-204ENST00000426921 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.45■■■□□ 2.14
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UBXN4-204ENST00000426921 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.43■■■□□ 2.14
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UBXN4-204ENST00000426921 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.43■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 DCAF5Q96JK2 942 aa28.43■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.42■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.42■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 ATG3Q9NT62 314 aa28.42■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 IL13P35225 146 aa28.41■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.41■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 MSL1Q68DK7 614 aa28.4■■■□□ 2.14
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
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