RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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PTPRN2-204ENST00000404321 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.62■■□□□ 1.53
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PTPRN2-204ENST00000404321 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2-204ENST00000404321 PAPPAQ13219 1627 aa24.47■■□□□ 1.51
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PTPRN2-204ENST00000404321 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRN2-204ENST00000404321 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
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PTPRN2-204ENST00000404321 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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PTPRN2-204ENST00000404321 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.38■■□□□ 1.49
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PTPRN2-204ENST00000404321 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRN2-204ENST00000404321 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
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PTPRN2-204ENST00000404321 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2-204ENST00000404321 MTFR1LQ9H019 292 aa24.35■■□□□ 1.49
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PTPRN2-204ENST00000404321 MSH5O43196 834 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2-204ENST00000404321 PRKAR2BP31323 418 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP6V1AP38606 617 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRN2-204ENST00000404321 PTGER2P43116 358 aa24.33■■□□□ 1.49
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