RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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SZRD1-201ENST00000401088 GTF3C6Q969F1 213 aa14.67□□□□□ -0.06
SZRD1-201ENST00000401088 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SZRD1-201ENST00000401088 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.67□□□□□ -0.06
SZRD1-201ENST00000401088 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SZRD1-201ENST00000401088 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.66□□□□□ -0.06
SZRD1-201ENST00000401088 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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SZRD1-201ENST00000401088 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SZRD1-201ENST00000401088 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.66□□□□□ -0.06
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SZRD1-201ENST00000401088 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SZRD1-201ENST00000401088 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.64□□□□□ -0.07
SZRD1-201ENST00000401088 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.64□□□□□ -0.07
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SZRD1-201ENST00000401088 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.63□□□□□ -0.07
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SZRD1-201ENST00000401088 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.63□□□□□ -0.07
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SZRD1-201ENST00000401088 ZNF428Q96B54 188 aa14.62□□□□□ -0.07
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SZRD1-201ENST00000401088 SKILP12757 684 aa14.58□□□□□ -0.08
SZRD1-201ENST00000401088 JPH4Q96JJ6 628 aa14.58□□□□□ -0.08
SZRD1-201ENST00000401088 DISP1Q96F81 1524 aa14.58□□□□□ -0.08
SZRD1-201ENST00000401088 VAMP4O75379 141 aa14.58□□□□□ -0.08
SZRD1-201ENST00000401088 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.58□□□□□ -0.08
SZRD1-201ENST00000401088 UBXN4Q92575 508 aa14.58□□□□□ -0.08
SZRD1-201ENST00000401088 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.58□□□□□ -0.08
SZRD1-201ENST00000401088 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.58□□□□□ -0.08
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