RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 NPATQ14207 1427 aa8.47□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 NOS1P29475 1434 aa8.46□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.46□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 CEP152O94986 1710 aa8.46□□□□□ -1.05
C6orf48-208ENST00000395788 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.46□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 LAMC1P11047 1609 aa8.46□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 RCCD1A6NED2 376 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 H3BM21 787 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 J3QL48 77 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 USP47Q96K76 1375 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC7Q96M83 1385 aa8.45□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 GSK3AP49840 483 aa8.44□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 KCNMA1Q12791 1236 aa8.44□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 E2F4Q16254 413 aa8.44□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 HPS1Q92902 700 aa8.44□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 MYOM2P54296 1465 aa8.44□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRB3O60242 1522 aa8.44□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.44□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 TSPOAP1O95153 1857 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 GGT6Q6P531 493 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 THAP11Q96EK4 314 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ERBB4Q15303 1308 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 PIK3C2BO00750 1634 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 MADDQ8WXG6 1647 aa8.43□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 RGL3Q3MIN7 710 aa8.42□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.42□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.42□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.41□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.41□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.41□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.4□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 SYNMO15061 1565 aa8.4□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.4□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 VEGFBP49765 207 aa8.4□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.4□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
C6orf48-208ENST00000395788 IFT172Q9UG01 1749 aa8.4□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.4□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 CCER2I3L3R5 266 aa8.39□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 KIF1BO60333 1816 aa8.38□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 MROH2AA6NES4 1674 aa8.38□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.38□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 ZFYVE9O95405 1425 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM32Q13049 653 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 PTGDRQ13258 359 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 MORN1Q5T089 497 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 TESK2Q96S53 571 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 ERVK-7P63135 1459 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 IQGAP1P46940 1657 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.37□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.36□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 PIK3C2GO75747 1445 aa8.36□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.35□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.35□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 ANP32CO43423 234 aa8.35□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 IDI1Q13907 227 aa8.35□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 PPLO60437 1756 aa8.35□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.34□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.34□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.34□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
C6orf48-208ENST00000395788 SOCS7O14512 581 aa8.33□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 FAM161AQ3B820 660 aa8.33□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.33□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.33□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRB1O14514 1584 aa8.32□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 VSIG8P0DPA2 414 aa8.32□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 MSS51Q4VC12 460 aa8.32□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 BMP1P13497 986 aa8.31□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.31□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
C6orf48-208ENST00000395788 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms