RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLSCR1O15162 318 aa22.46■■□□□ 1.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.46■■□□□ 1.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRP5O75197 1615 aa22.46■■□□□ 1.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.45■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNQ2O43526 872 aa22.44■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 PAPPAQ13219 1627 aa22.43■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 PROM2Q8N271 834 aa22.43■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.42■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.42■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 LY75O60449 1722 aa22.41■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 EYA1Q99502 592 aa22.4■■□□□ 1.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITGB4P16144 1822 aa22.39■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 CASZ1Q86V15 1759 aa22.38■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.38■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.38■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.37■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 MORC1Q86VD1 984 aa22.37■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.36■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP27B1O15528 508 aa22.34■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 TXNRD1Q16881 649 aa22.33■■□□□ 1.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.32■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.32■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 KDRP35968 1356 aa22.31■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.164e-7■□□□□ 9.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.31■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.29■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL13P35225 146 aa22.28■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.27■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.26■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTHFSP49914 203 aa22.25■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF14Q5TI25 921 aa22.25■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.25■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.23■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHKG2P15735 406 aa22.22■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPG7Q9UQ90 795 aa22.22■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 C5P01031 1676 aa22.22■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.21■■□□□ 1.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.2■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC15A2Q16348 729 aa22.19■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF827Q17R98 1081 aa22.19■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.19■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 AKT1S1Q96B36 256 aa22.18■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.17■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.17■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.16■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIGBQ92521 554 aa22.15■■□□□ 1.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNQ4P56696 695 aa22.14■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 STK32BQ9NY57 414 aa22.14■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 PALLDQ8WX93 1383 aa22.13■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.13■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.12■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.12■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 C4BP0C0L5 1744 aa22.11■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRC1P22897 1456 aa22.1■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP2R1AP30153 589 aa22.1■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCAF5Q96JK2 942 aa22.09■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.09■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.08■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.08■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTGER2P43116 358 aa22.08■■□□□ 1.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 HMOX1P09601 288 aa22.07■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPON1Q9HCB6 807 aa22.07■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATG3Q9NT62 314 aa22.06■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.06■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.06■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 TJP1Q07157 1748 aa22.03■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB7AO95365 584 aa22.03■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.03■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.02■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.02■■□□□ 1.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTFR1LQ9H019 292 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms