RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 ERVK-9P63128 1117 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRK-202ENST00000368205 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRK-202ENST00000368205 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
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PTPRK-202ENST00000368205 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRK-202ENST00000368205 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRK-202ENST00000368205 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 MX2P20592 715 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 ACDQ96AP0 544 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 A0A1B0GTH6 734 aa9.61□□□□□ -0.87
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