RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 IGF1RP08069 1367 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM23O75077 832 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 MSTNO14793 375 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 DBN1Q16643 649 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 CYLDQ9NQC7 956 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PTPRC-202ENST00000367364 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 GMCL1Q96IK5 515 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 AP1G2O75843 785 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 PROCP04070 461 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 BCRP11274 1271 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 ACDQ96AP0 544 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L8P0C7I0 530 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 GPC1P35052 558 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 PODNQ7Z5L7 613 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRC-202ENST00000367364 MEN1O00255 615 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 PNMA1Q8ND90 353 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PRU2 124 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 POU4F2Q12837 409 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 H7C1W4 665 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 OIP5O43482 229 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 FAM117AQ9C073 453 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-202ENST00000367364 MX2P20592 715 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 ERVK-9P63128 1117 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 NBPF15Q8N660 670 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 THBS1P07996 1170 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 KRBA1A5PL33 1030 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 RFC5P40937 340 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 CLN3Q13286 438 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM52Q96A61 297 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 SCTRP47872 440 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 NLRP3Q96P20 1036 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRC-202ENST00000367364 ZBBXA8MT70 800 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO45P0C2W1 286 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 BAG6P46379 1132 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 WDR44Q5JSH3 913 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 F11P03951 625 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 COL8A1P27658 744 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 MAP2K3P46734 347 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 TRAK2O60296 914 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC125Q86Z20 511 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 KLRG1Q96E93 195 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRC-202ENST00000367364 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PTPRC-202ENST00000367364 FURINP09958 794 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRC-202ENST00000367364 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRC-202ENST00000367364 Q8N3U1 123 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRC-202ENST00000367364 GPAMQ9HCL2 828 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRC-202ENST00000367364 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRC-202ENST00000367364 RNF20Q5VTR2 975 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRC-202ENST00000367364 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms