RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTF1AQ7RTS3 328 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNERQ8NFT8 737 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C10orf95Q9H7T3 257 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBLCQ9ULV8 474 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGB4P16144 1822 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TUSC1Q2TAM9 212 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM110AQ9BQ89 295 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00846Q9NV44 126 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAH5Q8TE73 4624 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFPP27918 469 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGFL4Q6B9Z1 124 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRIM1Q9NZV1 1036 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZZEF1O43149 2961 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTEFA5A3E0 1075 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOCS7O14512 581 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JAG1P78504 1218 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHIAQ9BZP6 476 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPRY4Q9C004 299 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OGFRQ9NZT2 677 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRPK3Q9UPE1 567 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa-1.72□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.72□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RELNP78509 3460 aa-1.72□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-1.72□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP290O15078 2479 aa-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUSD5O60279 629 aa-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNC3Q14003 757 aa-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SP8Q8IXZ3 490 aa-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACSS3Q9H6R3 686 aa-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDH7O60245 1069 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ELFN1P0C7U0 828 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBMY1CP0DJD4 496 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POU5F1BQ06416 359 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCF24Q7RTU0 167 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT82Q9NSB4 513 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF19AQ9NV58 838 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED13Q9UHV7 2174 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CADP27708 2225 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NID1P14543 1247 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SF1Q15637 639 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADRA1BP35368 520 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRE11P49959 708 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT83P78385 493 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCTD2Q14681 263 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EHMT2Q96KQ7 1210 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAMKK2Q96RR4 588 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PI4KAP42356 2102 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SP1P08047 785 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD97P48960 835 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EPHB4P54760 987 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MTMR3Q13615 1198 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TGIF1Q15583 401 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR162Q16538 588 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EDA2RQ9HAV5 297 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 THRBP10828 461 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFNA3P52797 238 aa-1.78□□□□□ -2.69
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