RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 MNS1Q8NEH6 495 aa25.04■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.03■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.03■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.02■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.02■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SMURF1-201ENST00000361125 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.01■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 IDI1Q13907 227 aa25.01■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 NOS1P29475 1434 aa25.01■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 SSH1Q8WYL5 1049 aa25■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 OFD1O75665 1012 aa25■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 TXLNAP40222 546 aa25■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 RAI14Q9P0K7 980 aa25■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 MYD88Q99836 296 aa24.99■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.99■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 TDO2P48775 406 aa24.99■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.98■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 ME1P48163 572 aa24.98■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 SPC24Q8NBT2 197 aa24.98■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 STARD3NLO95772 234 aa24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 F6X3S4 739 aa24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 FOXO3O43524 673 aa24.96■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.96■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.96■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.96■■□□□ 1.59
SMURF1-201ENST00000361125 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 FANCAO15360 1455 aa24.94■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 ODF2Q5BJF6 829 aa24.94■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 TNMDQ9H2S6 317 aa24.94■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.94■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 METTL24Q5JXM2 366 aa24.94■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 CAGE1Q8TC20 777 aa24.94■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.94■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 PTPRKQ15262 1439 aa24.93■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.93■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 MAP7D2Q96T17 732 aa24.93■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 MX1P20591 662 aa24.93■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.93■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.93■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.93■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 JMYQ8N9B5 988 aa24.92■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 KRT85P78386 507 aa24.92■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 RUFY1Q96T51 708 aa24.92■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.91■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 MPNDQ8N594 471 aa24.91■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.91■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.91■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 ABCF2Q9UG63 623 aa24.9■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 AIDAQ96BJ3 306 aa24.9■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 ADAMTS2O95450 1211 aa24.89■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 SERPINC1P01008 464 aa24.89■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.89■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 SOGA3Q5TF21 947 aa24.89■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.89■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.89■■□□□ 1.58
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC192P0DO97 292 aa24.89■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 TEX35Q5T0J7 233 aa24.89■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 SPATA32Q96LK8 384 aa24.89■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 DDX11Q96FC9 970 aa24.89■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 ABCC11Q96J66 1382 aa24.88■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 RAB11FIP3O75154 756 aa24.88■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.88■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 SMARCE1Q969G3 411 aa24.88■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 FBXO3Q9UK99 471 aa24.87■■□□□ 1.57
SMURF1-201ENST00000361125 ESPNB1AK53 854 aa24.87■■□□□ 1.57
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