RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354940.10

TXNRD1-201, Transcript of thioredoxin reductase 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene TXNRD1, Length 4,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1-201ENST00000354940 PTPN14Q15678 1187 aa14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 FEZ1Q99689 392 aa14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 NLRP1Q9C000 1473 aa14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 PBRM1Q86U86 1689 aa14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 GPS2Q13227 327 aa14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ABCC11Q96J66 1382 aa14.7□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ADAMTS12P58397 1594 aa14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 UBE2HP62256 183 aa14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 SLC4A2P04920 1241 aa14.68□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 STX6O43752 255 aa14.68□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 KRT85P78386 507 aa14.68□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.68□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 SAMD9Q5K651 1589 aa14.68□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.68□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 CEP135Q66GS9 1140 aa14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 DDIT3P35638 169 aa14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ZBTB9Q96C00 473 aa14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 LUZP1Q86V48 1076 aa14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ZNF428Q96B54 188 aa14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 STK3Q13188 491 aa14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 F6X3S4 739 aa14.66□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 OSCARQ8IYS5 282 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 FAM83GA6ND36 823 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 LRMPQ12912 555 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 NFE2L2Q16236 605 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 MEIS3Q99687 375 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 SMC2O95347 1197 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 BRD1O95696 1058 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 GTF3C6Q969F1 213 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 DCTPP1Q9H773 170 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.65□□□□□ -0.06
TXNRD1-201ENST00000354940 FCHSD2O94868 740 aa14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 MBIPQ9NS73 344 aa14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 TPM4P67936 248 aa14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 KIF18AQ8NI77 898 aa14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 SPATA32Q96LK8 384 aa14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 SMTNL1A8MU46 457 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 VAMP4O75379 141 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 NUP160Q12769 1436 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 ABCC2Q92887 1545 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 GNAI2P04899 355 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 ZNF165P49910 485 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.63□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 NUTM2FA1L443 756 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 PDE1AP54750 535 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 CERS3Q8IU89 383 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 ADGRL2O95490 1459 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 GJB2P29033 226 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 UBXN4Q92575 508 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 SDF4Q9BRK5 362 aa14.62□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.61□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.61□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 SPG7Q9UQ90 795 aa14.61□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 IL16Q14005 1332 aa14.61□□□□□ -0.07
TXNRD1-201ENST00000354940 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms