RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.61□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GUA9 196 aa9.6□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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PKHD1-201ENST00000340994 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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PKHD1-201ENST00000340994 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.6□□□□□ -0.87
PKHD1-201ENST00000340994 TTC14Q96N46 770 aa9.6□□□□□ -0.87
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PKHD1-201ENST00000340994 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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PKHD1-201ENST00000340994 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.58□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.58□□□□□ -0.88
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PKHD1-201ENST00000340994 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.58□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 KIF3CO14782 793 aa9.58□□□□□ -0.88
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PKHD1-201ENST00000340994 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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PKHD1-201ENST00000340994 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 HECW1Q76N89 1606 aa9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.57□□□□□ -0.88
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PKHD1-201ENST00000340994 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 OPA1O60313 960 aa9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 GOLIM4O00461 696 aa9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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PKHD1-201ENST00000340994 CEP135Q66GS9 1140 aa9.57□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 HOOK3Q86VS8 718 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 EBAG9O00559 213 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 YEATS4O95619 227 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
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PKHD1-201ENST00000340994 CLGNO14967 610 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 HSF2BPO75031 334 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 FOSBP53539 338 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GUL7 405 aa9.56□□□□□ -0.88
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PKHD1-201ENST00000340994 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.56□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
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PKHD1-201ENST00000340994 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 KLHL40Q2TBA0 621 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 TERF1P54274 439 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 POTEDQ86YR6 584 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 WDR63Q8IWG1 891 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.55□□□□□ -0.88
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