RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZFYVE9O95405 1425 aa27.38■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 ST18O60284 1047 aa27.38■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP44Q96MT7 982 aa27.37■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.37■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEO1Q92859 1461 aa27.37■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT24Q2M2I5 525 aa27.37■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF214Q8ND24 703 aa27.36■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.35■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.35■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 REREQ9P2R6 1566 aa27.35■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 TERF1P54274 439 aa27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL13P35225 146 aa27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRSAM1Q6UWE0 723 aa27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 UQCRHLA0A096LP55 91 aa27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 UQCRHP07919 91 aa27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP85Q6P2H3 762 aa27.33■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIK3C2BO00750 1634 aa27.33■■□□□ 1.97
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARID3AQ99856 593 aa27.33■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP10DQ9P241 1426 aa27.32■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 CASC1Q6TDU7 716 aa27.31■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.29■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 MEIS3Q99687 375 aa27.29■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.28■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEK4P51957 841 aa27.28■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.28■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 NME9Q86XW9 330 aa27.28■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 REC8O95072 547 aa27.27■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMX3Q96JJ7 454 aa27.27■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.27■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.26■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERC2O15083 957 aa27.26■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.26■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSH6P52701 1360 aa27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 RICTORQ6R327 1708 aa27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 MPNDQ8N594 471 aa27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTL1A6NKG5 1358 aa27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGS12O14924 1447 aa27.23■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.23■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.21■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.2■■□□□ 1.95
GRAMD1A-201ENST00000317991 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.2■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 PALD1Q9ULE6 856 aa27.2■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 BRD1O95696 1058 aa27.19■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCM5P33992 734 aa27.19■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.19■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDE1AP54750 535 aa27.18■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 MBD3O95983 291 aa27.18■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCM10Q7L590 875 aa27.18■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP7D2Q96T17 732 aa27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSPY26PQ9H489 355 aa27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 DYNC1I1O14576 645 aa27.15■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.949e-7■■■□□ 15.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.14■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.14■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 F6X3S4 739 aa27.14■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.14■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.14■■□□□ 1.94
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC4A2P04920 1241 aa27.13■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRDM4Q9UKN5 801 aa27.13■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.13■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 CUL4AQ13619 759 aa27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 G2E3Q7L622 706 aa27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALKQ9UM73 1620 aa27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHL1O00533 1208 aa27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSC1Q92574 1164 aa27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.11■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.1■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 COG3Q96JB2 828 aa27.1■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.09■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms