RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CHL1O00533 1208 aa34.34■■■■□ 3.09
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HOXD8-201ENST00000313173 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.33■■■■□ 3.09
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HOXD8-201ENST00000313173 NBPF4Q96M43 638 aa34.27■■■■□ 3.08
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HOXD8-201ENST00000313173 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
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HOXD8-201ENST00000313173 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.24■■■■□ 3.07
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HOXD8-201ENST00000313173 RGPD5Q99666 1765 aa34.16■■■■□ 3.06
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HOXD8-201ENST00000313173 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXD8-201ENST00000313173 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
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HOXD8-201ENST00000313173 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
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HOXD8-201ENST00000313173 MIS18AQ9NYP9 233 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC6O95255 1503 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXD8-201ENST00000313173 BABAM1Q9NWV8 329 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXD8-201ENST00000313173 COL18A1P39060 1754 aa34.11■■■■□ 3.05
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HOXD8-201ENST00000313173 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
HOXD8-201ENST00000313173 FAM161AQ3B820 660 aa33.87■■■■□ 3.01
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