RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC10-201ENST00000291574 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 DEF6Q9H4E7 631 aa16.03■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.03■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.01■□□□□ 0.15
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ZMYND15Q9H091 742 aa15.99■□□□□ 0.15
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ADCY5O95622 1261 aa15.98■□□□□ 0.15
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 NCOA1Q15788 1441 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.96■□□□□ 0.15
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.96■□□□□ 0.15
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TRAPPC10-201ENST00000291574 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.95■□□□□ 0.14
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TRAPPC10-201ENST00000291574 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 CDKL5O76039 1030 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPG7Q9UQ90 795 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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