RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.66■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.66■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 ERBB4Q15303 1308 aa22.65■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 PTMSP20962 102 aa22.65■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.65■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.65■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.65■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 CEP85Q6P2H3 762 aa22.64■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 ALKQ9UM73 1620 aa22.64■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 NEK4P51957 841 aa22.63■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.63■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.63■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.63■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 G2E3Q7L622 706 aa22.63■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 MCCP23508 829 aa22.62■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.62■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 GNAI2P04899 355 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 NUCB2P80303 420 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 CLCN1P35523 988 aa22.61■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 CHL1O00533 1208 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 ERC2O15083 957 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.6■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 MSH6P52701 1360 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 USP32Q8NFA0 1604 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 ADGRB2O60241 1585 aa22.59■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 MED14O60244 1454 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 KIF2CQ99661 725 aa22.58■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
LRP3-201ENST00000253193 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 USP26Q9BXU7 913 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 PTPRCP08575 1304 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 ATP7BP35670 1465 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 DDIT3P35638 169 aa22.57■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 ESPNB1AK53 854 aa22.56■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.56■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.56■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.55■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 ABTB2Q8N961 1025 aa22.55■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.55■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.55■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 PTCH1Q13635 1447 aa22.54■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.54■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 GNAI3P08754 354 aa22.53■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 FLIIQ13045 1269 aa22.53■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.53■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 PDE1AP54750 535 aa22.52■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 EYA1Q99502 592 aa22.52■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 PKP1Q13835 747 aa22.52■■□□□ 1.2
LRP3-201ENST00000253193 TNRQ92752 1358 aa22.51■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.51■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.5■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 PIK3R4Q99570 1358 aa22.5■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.5■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 MX1P20591 662 aa22.5■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 LTKP29376 864 aa22.5■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 RTL1A6NKG5 1358 aa22.5■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.49■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.49■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.48■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.48■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 RNF214Q8ND24 703 aa22.47■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.47■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.46■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.46■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.46■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 CPS1P31327 1500 aa22.45■■□□□ 1.19
LRP3-201ENST00000253193 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.45■■□□□ 1.18
LRP3-201ENST00000253193 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.45■■□□□ 1.18
LRP3-201ENST00000253193 PLCB2Q00722 1185 aa22.45■■□□□ 1.18
LRP3-201ENST00000253193 TEFQ10587 303 aa22.45■■□□□ 1.18
LRP3-201ENST00000253193 KCNJ4P48050 445 aa22.44■■□□□ 1.18
LRP3-201ENST00000253193 TSPOAP1O95153 1857 aa22.44■■□□□ 1.18
LRP3-201ENST00000253193 AK9Q5TCS8 1911 aa22.43■■□□□ 1.18
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