RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 TNS2Q63HR2 1409 aa25.98■■□□□ 1.75
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HOXD11-201ENST00000249504 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 HMOX1P09601 288 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 KDRP35968 1356 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 FAM182BQ5T319 152 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 SPG7Q9UQ90 795 aa25.88■■□□□ 1.73
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HOXD11-201ENST00000249504 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 FCHSD2O94868 740 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD11-201ENST00000249504 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.83■■□□□ 1.73
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HOXD11-201ENST00000249504 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 SBF2Q86WG5 1849 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 CYP27B1O15528 508 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 BCL9O00512 1426 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 NEFMP07197 916 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 RUNDC1Q96C34 613 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD11-201ENST00000249504 EP400Q96L91 3159 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 PHKG2P15735 406 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM37O94972 964 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.73■■□□□ 1.71
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HOXD11-201ENST00000249504 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 SOCS7O14512 581 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD11-201ENST00000249504 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
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HOXD11-201ENST00000249504 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC125Q86Z20 511 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 APAF1O14727 1248 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 DCAF5Q96JK2 942 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 ITGB4P16144 1822 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 KCNQ2O43526 872 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 MAP3K5Q99683 1374 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 NFE2L2Q16236 605 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 BTAF1O14981 1849 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD11-201ENST00000249504 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 APBA3O96018 575 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 BAG6P46379 1132 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.6■■□□□ 1.69
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HOXD11-201ENST00000249504 NGEFQ8N5V2 710 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 RIPK4P57078 832 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD11-201ENST00000249504 NEUROD2Q15784 382 aa25.58■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 LGR6Q9HBX8 967 aa25.58■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC27Q2M243 656 aa25.55■■□□□ 1.68
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