RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000247668.6

TRAF2-201, Transcript of TNF receptor associated factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF2, Length 2,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2-201ENST00000247668 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF2-201ENST00000247668 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAF2-201ENST00000247668 KIAA0232Q92628 1395 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF2-201ENST00000247668 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.2■■□□□ 1.15
TRAF2-201ENST00000247668 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
TRAF2-201ENST00000247668 ERBB3P21860 1342 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 CRB1P82279 1406 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 MYT1Q01538 1121 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 LGR6Q9HBX8 967 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 CHL1O00533 1208 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 TRIM27P14373 513 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAF2-201ENST00000247668 PDE3AQ14432 1141 aa22.15■■□□□ 1.14
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TRAF2-201ENST00000247668 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 MAP3K5Q99683 1374 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 IGHDP01880 384 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 COL18A1P39060 1754 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 KCNQ3O43525 872 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 NECTIN2Q92692 538 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.08■■□□□ 1.13
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TRAF2-201ENST00000247668 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAF2-201ENST00000247668 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 NCAPD2Q15021 1401 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 PIP4K2BP78356 416 aa22.05■■□□□ 1.12
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TRAF2-201ENST00000247668 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 STRN4Q9NRL3 753 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 MEGF6O75095 1541 aa22.05■■□□□ 1.12
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TRAF2-201ENST00000247668 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 USP35Q9P2H5 1018 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.02■■□□□ 1.12
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TRAF2-201ENST00000247668 G2E3Q7L622 706 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAF2-201ENST00000247668 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.01■■□□□ 1.11
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TRAF2-201ENST00000247668 SLC4A2P04920 1241 aa22■■□□□ 1.11
TRAF2-201ENST00000247668 AMOTQ4VCS5 1084 aa22■■□□□ 1.11
TRAF2-201ENST00000247668 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22■■□□□ 1.11
TRAF2-201ENST00000247668 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF2-201ENST00000247668 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.99■■□□□ 1.11
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TRAF2-201ENST00000247668 LRRC37A3O60309 1634 aa21.99■■□□□ 1.11
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TRAF2-201ENST00000247668 CYP27B1O15528 508 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF2-201ENST00000247668 ZNF428Q96B54 188 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF2-201ENST00000247668 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF2-201ENST00000247668 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.97■■□□□ 1.11
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TRAF2-201ENST00000247668 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF2-201ENST00000247668 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF2-201ENST00000247668 ADAMTS2O95450 1211 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAF2-201ENST00000247668 EVA1CP58658 441 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAF2-201ENST00000247668 RGS12O14924 1447 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAF2-201ENST00000247668 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TRAF2-201ENST00000247668 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TRAF2-201ENST00000247668 ABCC4O15439 1325 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAF2-201ENST00000247668 RGS3P49796 1198 aa21.91■■□□□ 1.1
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