RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 SHANK3Q9BYB0 1731 aa41.85■■■■■ 4.29
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INO80B-201ENST00000233331 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa41.83■■■■■ 4.29
INO80B-201ENST00000233331 NCAPD2Q15021 1401 aa41.81■■■■■ 4.28
INO80B-201ENST00000233331 KCNQ2O43526 872 aa41.81■■■■■ 4.28
INO80B-201ENST00000233331 NUP188Q5SRE5 1749 aa41.81■■■■■ 4.28
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INO80B-201ENST00000233331 EYA1Q99502 592 aa41.8■■■■■ 4.28
INO80B-201ENST00000233331 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
INO80B-201ENST00000233331 PLSCR1O15162 318 aa41.78■■■■■ 4.28
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INO80B-201ENST00000233331 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa41.7■■■■■ 4.27
INO80B-201ENST00000233331 BTAF1O14981 1849 aa41.7■■■■■ 4.27
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INO80B-201ENST00000233331 PKD1L3Q7Z443 1732 aa41.69■■■■■ 4.27
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INO80B-201ENST00000233331 PROM2Q8N271 834 aa41.62■■■■■ 4.25
INO80B-201ENST00000233331 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
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INO80B-201ENST00000233331 CYP27B1O15528 508 aa41.6■■■■■ 4.25
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INO80B-201ENST00000233331 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa41.49■■■■■ 4.23
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INO80B-201ENST00000233331 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
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INO80B-201ENST00000233331 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa41.42■■■■■ 4.22
INO80B-201ENST00000233331 PAPPAQ13219 1627 aa41.41■■■■■ 4.22
INO80B-201ENST00000233331 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa41.41■■■■■ 4.22
INO80B-201ENST00000233331 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
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INO80B-201ENST00000233331 LY75O60449 1722 aa41.4■■■■■ 4.22
INO80B-201ENST00000233331 SLC27A3Q5K4L6 730 aa41.39■■■■■ 4.22
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INO80B-201ENST00000233331 PALLDQ8WX93 1383 aa41.3■■■■■ 4.2
INO80B-201ENST00000233331 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
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INO80B-201ENST00000233331 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
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INO80B-201ENST00000233331 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa41.08■■■■■ 4.17
INO80B-201ENST00000233331 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
INO80B-201ENST00000233331 MTFR1LQ9H019 292 aa41.06■■■■■ 4.16
INO80B-201ENST00000233331 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
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INO80B-201ENST00000233331 C4BP0C0L5 1744 aa41.04■■■■■ 4.16
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