RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 CBX1P83916 185 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 PALD1Q9ULE6 856 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 REC8O95072 547 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 FIBPO43427 364 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CTDP1-201ENST00000075430 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 ERC2O15083 957 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 G2E3Q7L622 706 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 DCTPP1Q9H773 170 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 CPA1P15085 419 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 TSPY26PQ9H489 355 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF445P59923 1031 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 FOXO3O43524 673 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 CEP85Q6P2H3 762 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 MROH2AA6NES4 1674 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 IL16Q14005 1332 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-201ENST00000075430 ABCC3O15438 1527 aa20.33■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 CFAP44Q96MT7 982 aa20.33■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.33■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 IFT57Q9NWB7 429 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 ZMYM3Q14202 1370 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 USP48Q86UV5 1035 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 SHPRHQ149N8 1683 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 MCCP23508 829 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 PDE1AP54750 535 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 MSH6P52701 1360 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 ADGRB3O60242 1522 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 FERMT3Q86UX7 667 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 NSD2O96028 1365 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 ABCC4O15439 1325 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 HMMRO75330 724 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 ADCY5O95622 1261 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 CAMK4Q16566 473 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 DRC7Q8IY82 874 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 DEPDC5O75140 1603 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-201ENST00000075430 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 SPG7Q9UQ90 795 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 MBD3O95983 291 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 AMPHP49418 695 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 FBXW7Q969H0 707 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 IL13P35225 146 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 FOSBP53539 338 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 GLI2P10070 1586 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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